More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0478 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  100 
 
 		 634 aa  1246    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  72.68 
 
 		 629 aa  905    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  53.64 
 
 		 652 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  53.48 
 
 		 652 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  53.48 
 
 		 652 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  40.26 
 
 		 643 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  40.66 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  37.54 
 
 		 648 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  38.01 
 
 		 643 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  38.24 
 
 		 646 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  38.29 
 
 		 663 aa  375  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  40.31 
 
 		 679 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  39.2 
 
 		 678 aa  364  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.54 
 
 		 646 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0297  ABC transporter related  37.73 
 
 		 682 aa  355  1e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  35.65 
 
 		 593 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  35.37 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  33.61 
 
 		 830 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  34.33 
 
 		 606 aa  271  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  35.15 
 
 		 608 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  34.56 
 
 		 611 aa  257  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  33.17 
 
 		 593 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  32.46 
 
 		 823 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  33.44 
 
 		 828 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  32.9 
 
 		 823 aa  244  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.27 
 
 		 609 aa  237  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  30.96 
 
 		 614 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  33.57 
 
 		 827 aa  233  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  29.97 
 
 		 582 aa  230  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  32.62 
 
 		 822 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  30.08 
 
 		 603 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  31.74 
 
 		 660 aa  225  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  31.6 
 
 		 594 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  30.63 
 
 		 594 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  32.62 
 
 		 593 aa  222  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.31 
 
 		 594 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  30.51 
 
 		 832 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  29.4 
 
 		 603 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  30.09 
 
 		 594 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  30.23 
 
 		 594 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  30.23 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  30.23 
 
 		 594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  30.45 
 
 		 589 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  45.63 
 
 		 610 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  30.23 
 
 		 594 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.23 
 
 		 594 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  30.23 
 
 		 594 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  30.55 
 
 		 599 aa  211  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.76 
 
 		 594 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  30.76 
 
 		 594 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.76 
 
 		 594 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.76 
 
 		 594 aa  210  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  30.24 
 
 		 590 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  30.43 
 
 		 594 aa  210  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 594 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  30.37 
 
 		 589 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  29.28 
 
 		 598 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2146  ABC transporter related  30.48 
 
 		 606 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 594 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.6 
 
 		 594 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  31.38 
 
 		 951 aa  207  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  28.92 
 
 		 950 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  46.03 
 
 		 258 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  46.03 
 
 		 258 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  46.03 
 
 		 258 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  46.03 
 
 		 258 aa  204  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  31.2 
 
 		 597 aa  203  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  45.56 
 
 		 256 aa  203  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  46.03 
 
 		 258 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 		 260 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  29.48 
 
 		 624 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  45.6 
 
 		 258 aa  201  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.63 
 
 		 258 aa  200  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  30.94 
 
 		 590 aa  200  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  43.87 
 
 		 260 aa  200  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  43.87 
 
 		 260 aa  200  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0216  ABC transporter related  29.55 
 
 		 565 aa  200  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  31.1 
 
 		 604 aa  200  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  46.56 
 
 		 256 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 		 258 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  45.27 
 
 		 257 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  43.48 
 
 		 257 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  45.27 
 
 		 257 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 257 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1145  leucine/isoleucine/valine transport system ATP-binding protein  44.27 
 
 		 257 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00253052  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0265  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 257 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000223083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.27 
 
 		 257 aa  198  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  32.11 
 
 		 840 aa  198  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 257 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 257 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.27 
 
 		 257 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6114  ABC transporter related  44.44 
 
 		 257 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2413  ABC transporter related  44.44 
 
 		 258 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0344655 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2542  ABC transporter related  44.44 
 
 		 258 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.812662  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.48 
 
 		 257 aa  197  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  28.55 
 
 		 631 aa  196  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  30.39 
 
 		 583 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  43.65 
 
 		 258 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 		 258 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  43.65 
 
 		 258 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>