More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2282 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  47.26 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  49.79 
 
 		 247 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  45.57 
 
 		 242 aa  214  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  49.37 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  49.16 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  49.37 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  48.95 
 
 		 244 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  48.95 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  49.79 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.03 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.24 
 
 		 265 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  45.99 
 
 		 245 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  45.85 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  45.42 
 
 		 241 aa  204  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.96 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  50.84 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.4 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4889  ABC transporter related  43.04 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  48.32 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  43.08 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.8 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 239 aa  201  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  46 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  45.06 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  50.43 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44 
 
 		 255 aa  198  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4800  ABC transporter related  41.77 
 
 		 251 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.773333  normal  0.195705 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  44.87 
 
 		 245 aa  197  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  43.65 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  42.57 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  43.03 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  43.22 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  45.15 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  45.02 
 
 		 255 aa  196  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  41 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  43.82 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  43.39 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  41.77 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  44.31 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  43.2 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.05 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  42.68 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  45.42 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.66 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  42.63 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  45.42 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  44.73 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  42.5 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.46 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  43.92 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.04 
 
 		 254 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  43.51 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  44.44 
 
 		 261 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 255 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 257 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  44.22 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  42.92 
 
 		 239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  42.86 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  44.22 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  44.22 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  41.18 
 
 		 265 aa  188  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  42.57 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  40.76 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  42.44 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  43.03 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  44.09 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  43.82 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  42.63 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  40.87 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  42.4 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.23 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  41.6 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  39.92 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  43.28 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  40.15 
 
 		 288 aa  185  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  41.73 
 
 		 270 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.5 
 
 		 241 aa  185  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>