More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2427 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  100 
 
 
239 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  97.91 
 
 
239 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  97.49 
 
 
239 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  87.03 
 
 
239 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  81.51 
 
 
239 aa  401  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  61.8 
 
 
242 aa  299  2e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  60.52 
 
 
242 aa  295  5e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  55.7 
 
 
240 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  50.21 
 
 
237 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  46.83 
 
 
264 aa  232  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  45.02 
 
 
256 aa  228  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.03 
 
 
265 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  48.78 
 
 
271 aa  225  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.46 
 
 
241 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  46.81 
 
 
244 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  48.51 
 
 
243 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  46 
 
 
256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  47.08 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.67 
 
 
254 aa  221  8e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  46.15 
 
 
241 aa  221  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  46.38 
 
 
244 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  46.43 
 
 
252 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  47.28 
 
 
239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  45.49 
 
 
255 aa  218  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.78 
 
 
271 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  46.58 
 
 
244 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  45.49 
 
 
239 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  46.38 
 
 
244 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  44.44 
 
 
245 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  47.48 
 
 
603 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  46.03 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  44.84 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  43.65 
 
 
257 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  46.22 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  46.22 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  46.22 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  44.84 
 
 
262 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  46.98 
 
 
242 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  46.4 
 
 
250 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  45.49 
 
 
259 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  46.75 
 
 
242 aa  209  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  44.44 
 
 
270 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
257 aa  208  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  46 
 
 
250 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  42.13 
 
 
256 aa  208  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  40.14 
 
 
307 aa  208  6e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  43.2 
 
 
251 aa  207  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  44.96 
 
 
283 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  40.81 
 
 
284 aa  207  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  43.6 
 
 
253 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  45.3 
 
 
245 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
256 aa  206  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  44.14 
 
 
270 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  47.01 
 
 
255 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.08 
 
 
254 aa  206  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  44.96 
 
 
293 aa  206  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  44.18 
 
 
250 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  44.96 
 
 
616 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  38.54 
 
 
302 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  45.02 
 
 
259 aa  205  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  44.4 
 
 
250 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.46 
 
 
256 aa  205  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.15 
 
 
258 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  41.18 
 
 
284 aa  204  8e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  43.55 
 
 
254 aa  204  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 
256 aa  204  1e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  46.58 
 
 
244 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4413  ABC transporter related  44.58 
 
 
271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222133  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  45.99 
 
 
249 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  45.63 
 
 
270 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
256 aa  204  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  43.2 
 
 
251 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
256 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  45.63 
 
 
270 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  43.65 
 
 
259 aa  203  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
255 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
256 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  41.5 
 
 
255 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  43.6 
 
 
253 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  41.73 
 
 
255 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  44.22 
 
 
255 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  42.74 
 
 
261 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  42.4 
 
 
280 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 
256 aa  201  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
589 aa  201  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
294 aa  201  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  43.03 
 
 
256 aa  202  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  43.6 
 
 
259 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  44 
 
 
252 aa  201  7e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  40.96 
 
 
263 aa  201  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  41.2 
 
 
256 aa  201  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 
256 aa  201  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  44.4 
 
 
254 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  44.62 
 
 
271 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  42.63 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 
256 aa  200  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  42.29 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 
255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>