More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5992 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  71.26 
 
 		 247 aa  344  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  61.41 
 
 		 253 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  61.83 
 
 		 253 aa  298  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  48.1 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  49.59 
 
 		 242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  52.79 
 
 		 243 aa  231  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  49.14 
 
 		 239 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  49.58 
 
 		 242 aa  229  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  49.6 
 
 		 603 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.46 
 
 		 609 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  48.72 
 
 		 245 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  49.36 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  49.79 
 
 		 243 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  46.64 
 
 		 245 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  48.76 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  48.09 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  46.5 
 
 		 249 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  44.8 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  45.3 
 
 		 245 aa  215  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  47.03 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  48.12 
 
 		 616 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  45.38 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  47.41 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  44 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.95 
 
 		 244 aa  211  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  44.76 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  48.54 
 
 		 244 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  48.73 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  42.74 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  48.76 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  46.44 
 
 		 243 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  45.38 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  44.22 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  45.53 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  42.49 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  45.8 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  40.3 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  41.94 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  45.96 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.28 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  41.45 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  41.53 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  42.74 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  39.93 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  42.98 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  40.73 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  43.37 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  42.62 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  43.4 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  41.13 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  41.13 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  40.39 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  41.77 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  44.35 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  42 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  42.52 
 
 		 270 aa  194  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  42.74 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.16 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  44.58 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  42.4 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  42.57 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.32 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  41.3 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  41.11 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  43.95 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  42.91 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  42.06 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  44.09 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  44.19 
 
 		 277 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  43.87 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  43.37 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  41.2 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  42.34 
 
 		 275 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 256 aa  191  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  42.34 
 
 		 275 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  42.34 
 
 		 275 aa  191  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  44.62 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  44 
 
 		 258 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1394  ABC transporter related protein  48.39 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 253 aa  190  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  41.94 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  41.53 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  43.03 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  40.56 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  44.32 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  42.17 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  44.22 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  40.56 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.05 
 
 		 302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  44.22 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  38.19 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  44.22 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  41.11 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>