More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1678 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 238 aa  471  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  74.68 
 
 		 243 aa  357  9.999999999999999e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  64.68 
 
 		 253 aa  295  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  49.79 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  49.36 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  48.51 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  48.94 
 
 		 244 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  48.73 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  48.09 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  48.09 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  48.51 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  48.73 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  48.74 
 
 		 242 aa  214  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  42.98 
 
 		 238 aa  211  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 244 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.96 
 
 		 239 aa  209  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  45.99 
 
 		 241 aa  208  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  47.23 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  50.63 
 
 		 253 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  47.23 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  51.25 
 
 		 616 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  49.36 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  49.79 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  45.11 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  47.88 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  47.28 
 
 		 603 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.88 
 
 		 245 aa  198  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5244  ABC transporter ATP-binding protein  45.99 
 
 		 243 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  49.16 
 
 		 241 aa  197  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  44.68 
 
 		 244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  44.96 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  42.8 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  41.94 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  42.5 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  42.37 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5538  ABC transporter related  46.81 
 
 		 239 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0994391  hitchhiker  0.0000070517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  45.19 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  42 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  43.15 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  48.32 
 
 		 242 aa  192  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.29 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.44 
 
 		 609 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  47.26 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  41.6 
 
 		 278 aa  191  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  41.83 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  40.32 
 
 		 272 aa  190  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  42.98 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  41.37 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  46.34 
 
 		 589 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  45.12 
 
 		 590 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  43.78 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  47.48 
 
 		 242 aa  189  5e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.07 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  43.32 
 
 		 254 aa  188  7e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  42.91 
 
 		 254 aa  188  8e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  41.6 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  42.97 
 
 		 612 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  43.78 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  42.69 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  42.55 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  46.81 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  43.4 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  45.61 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  185  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  43.95 
 
 		 257 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  40.96 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  40.96 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4800  ABC transporter related  41.7 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.773333  normal  0.195705 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 589 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  44.72 
 
 		 260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  43.98 
 
 		 611 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  42.63 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  40.32 
 
 		 258 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  45.12 
 
 		 589 aa  182  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  39.84 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4889  ABC transporter related  41.28 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782331 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  44.44 
 
 		 254 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2586  ABC transporter related  41.35 
 
 		 237 aa  181  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  41.13 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  38.96 
 
 		 263 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 258 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.13 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.13 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  42.46 
 
 		 256 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  43.37 
 
 		 269 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  39.92 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  42.17 
 
 		 260 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.13 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>