More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6134 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  56.72 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5538  ABC transporter related  56.72 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0994391  hitchhiker  0.0000070517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5244  ABC transporter ATP-binding protein  53.16 
 
 		 243 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.104577 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4800  ABC transporter related  45.96 
 
 		 251 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.773333  normal  0.195705 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4889  ABC transporter related  45.96 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  45.53 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  48.09 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 243 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  42.44 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  42.74 
 
 		 245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  42.62 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  42.86 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  45.45 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  45.11 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  44.26 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  46.15 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.88 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  41.35 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  47.03 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  46.15 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  40.76 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  41.45 
 
 		 244 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  43.59 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  41.03 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  42.17 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  41.03 
 
 		 242 aa  185  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  45.38 
 
 		 243 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  43.16 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  42.74 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  41.95 
 
 		 249 aa  181  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  40.68 
 
 		 239 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  40.17 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3055  ABC transporter related  40.98 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  43.7 
 
 		 242 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  39.74 
 
 		 242 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 239 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  42.31 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  37.94 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  39.41 
 
 		 239 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  42.24 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2202  ABC transporter related  43.16 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  38.89 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  39.83 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7088  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.28 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.92 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  42.08 
 
 		 505 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  36.29 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  40.43 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  40.51 
 
 		 245 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  42.86 
 
 		 242 aa  174  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  39.43 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  36.36 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  39.15 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  39.33 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  39.33 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  38.4 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  41.7 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  40.59 
 
 		 603 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  42.74 
 
 		 247 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  38.11 
 
 		 536 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1209  ABC transporter related  44.72 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.714157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  37.15 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  42.21 
 
 		 608 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  41.6 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  39.57 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.75 
 
 		 609 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.4 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 		 248 aa  164  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  37.4 
 
 		 255 aa  164  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  37.15 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  39.11 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  38.25 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  40.08 
 
 		 873 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  39.11 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  40.91 
 
 		 504 aa  162  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  38 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  36.11 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4240  ABC transporter related  38.55 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  40.49 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  38.34 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  39.13 
 
 		 257 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 256 aa  161  7e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  39.59 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3640  ABC transporter related  44.31 
 
 		 249 aa  161  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  34.69 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  34.03 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.39 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  37.25 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  34 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  41.48 
 
 		 616 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>