More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1951 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  94.67 
 
 		 244 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  93.44 
 
 		 244 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  87.5 
 
 		 243 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  85.36 
 
 		 239 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  70.29 
 
 		 244 aa  335  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  66.39 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  64.02 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  50.42 
 
 		 245 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  48.72 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  47.3 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  46.28 
 
 		 245 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  47.93 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  47.95 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  49.16 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.36 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  47.72 
 
 		 245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  48.32 
 
 		 253 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  48.21 
 
 		 261 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  44.3 
 
 		 240 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  53.91 
 
 		 243 aa  218  5e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  49 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  47.44 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.82 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  43.9 
 
 		 307 aa  215  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  46.43 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  46 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  43.78 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44.8 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  46 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  46 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  49.37 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  43.55 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  44.44 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.98 
 
 		 264 aa  211  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  45.34 
 
 		 239 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  45.6 
 
 		 283 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  46.25 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  44 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  46 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  46.43 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  44.98 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  43.03 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  46.77 
 
 		 280 aa  208  8e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  48.51 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  49.36 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  43.7 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  45.1 
 
 		 255 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  46.41 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  47.28 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  45.8 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  47.28 
 
 		 616 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.53 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.33 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  47.06 
 
 		 253 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  45.27 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  48.39 
 
 		 594 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.39 
 
 		 594 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  44.58 
 
 		 603 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.39 
 
 		 594 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.39 
 
 		 594 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  42.8 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  48.39 
 
 		 594 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  43.53 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.39 
 
 		 594 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.39 
 
 		 594 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  43.43 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  44 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  44.72 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  43.92 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  44.53 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  45.38 
 
 		 244 aa  201  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  43.25 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  44.44 
 
 		 253 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  42.17 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  43.25 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  46.43 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.8 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.09 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.27 
 
 		 609 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  45.6 
 
 		 334 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  47.06 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  44.13 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  43.78 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  42.55 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  42.57 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  44.13 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  44.26 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  44.13 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  44.13 
 
 		 258 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  42.4 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>