More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1827 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  100 
 
 		 242 aa  497  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  80.58 
 
 		 242 aa  411  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.39 
 
 		 239 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  60.09 
 
 		 239 aa  295  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  60.52 
 
 		 239 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  60.52 
 
 		 239 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  60.52 
 
 		 239 aa  294  8e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  48.74 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  48.03 
 
 		 264 aa  229  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  47.18 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  47.58 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  46.85 
 
 		 265 aa  223  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  47.39 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  47.26 
 
 		 241 aa  221  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  45.6 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.92 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  46.37 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  45.56 
 
 		 280 aa  215  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  45.64 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  43.38 
 
 		 288 aa  215  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  40.85 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  45.02 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  46.03 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  43.55 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  44.76 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  45.6 
 
 		 271 aa  212  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  47.26 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  48.12 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  44.62 
 
 		 261 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  44.18 
 
 		 259 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 		 255 aa  211  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  47.26 
 
 		 244 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  43.78 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 256 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  43.48 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  46.34 
 
 		 608 aa  210  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  43.62 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  47.18 
 
 		 259 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  43.53 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  39.79 
 
 		 307 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  42.86 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  43.55 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  44.84 
 
 		 259 aa  208  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  45.92 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 255 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  43.37 
 
 		 252 aa  207  8e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.84 
 
 		 268 aa  207  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  40.66 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  40.68 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  44.35 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  45.02 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  42.92 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  46.41 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  45.56 
 
 		 278 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  45.12 
 
 		 593 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  40.66 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3830  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  45.88 
 
 		 271 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  205  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  45.76 
 
 		 616 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 276 aa  204  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  42.57 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.29 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  44.18 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  45.02 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  44 
 
 		 334 aa  203  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  44.07 
 
 		 603 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.12 
 
 		 589 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  43.37 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  45.12 
 
 		 590 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  42.41 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  41.9 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.08 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  43.55 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.59 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  43.15 
 
 		 253 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.19 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0694  inner-membrane translocator, ABC transporter related  44.58 
 
 		 583 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  44.12 
 
 		 255 aa  201  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  44.18 
 
 		 265 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>