More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0485 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  65.85 
 
 		 494 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  68.87 
 
 		 501 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  72.35 
 
 		 502 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  70.72 
 
 		 502 aa  690    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  100 
 
 		 490 aa  976    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  68.44 
 
 		 489 aa  663    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  40.74 
 
 		 822 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  40.95 
 
 		 827 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  39.88 
 
 		 823 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  40.08 
 
 		 823 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  38.17 
 
 		 832 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  40.46 
 
 		 828 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  36.95 
 
 		 484 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  38.33 
 
 		 830 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  38.1 
 
 		 536 aa  273  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  36.85 
 
 		 505 aa  270  5e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  35.62 
 
 		 549 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  35.73 
 
 		 842 aa  266  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  38.19 
 
 		 504 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  35.41 
 
 		 859 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  36.08 
 
 		 852 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  35.45 
 
 		 863 aa  249  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  36.7 
 
 		 873 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  33.83 
 
 		 573 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  33.13 
 
 		 838 aa  236  7e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  36.48 
 
 		 840 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  34.94 
 
 		 840 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  33.27 
 
 		 840 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1317  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 238 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5743  ABC transporter related  32.04 
 
 		 516 aa  202  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3805  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 261 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  31.13 
 
 		 501 aa  197  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  34.36 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4192  ABC transporter related protein  33.93 
 
 		 545 aa  196  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  46.12 
 
 		 249 aa  196  1e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  29.55 
 
 		 495 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3804  ABC transporter related protein  44 
 
 		 247 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0651651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  30.77 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  31.88 
 
 		 508 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 		 253 aa  189  9e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  32.04 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  48.2 
 
 		 234 aa  189  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1318  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 242 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  31.26 
 
 		 496 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  32.67 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  31.26 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  33.06 
 
 		 508 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2946  ABC transporter related  32.22 
 
 		 527 aa  187  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000498253 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  29.69 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  44.84 
 
 		 241 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  28.04 
 
 		 501 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  29.4 
 
 		 501 aa  187  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  46.02 
 
 		 247 aa  186  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  28.04 
 
 		 501 aa  186  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  29.3 
 
 		 501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  31.4 
 
 		 501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  30.89 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3573  ABC transporter related  45.7 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.402201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  29.8 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  31.33 
 
 		 506 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  45.61 
 
 		 270 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 247 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  30.64 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  46.15 
 
 		 239 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0752  ABC transporter related  31.64 
 
 		 551 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.971835  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 		 235 aa  184  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 237 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  43.86 
 
 		 247 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  27.03 
 
 		 496 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  45.13 
 
 		 247 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  46.54 
 
 		 233 aa  183  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  45.13 
 
 		 247 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  49.3 
 
 		 240 aa  183  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  29.63 
 
 		 501 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 236 aa  183  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2667  ABC transporter related  31.85 
 
 		 505 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 247 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  45.5 
 
 		 239 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3540  ABC transporter related  31.15 
 
 		 506 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  32.06 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  43.75 
 
 		 247 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  28.6 
 
 		 505 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  47.58 
 
 		 248 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  47.56 
 
 		 233 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  45.5 
 
 		 247 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45 
 
 		 237 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  31.91 
 
 		 498 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  48.86 
 
 		 234 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  49.31 
 
 		 241 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0506  ABC transporter related  41.86 
 
 		 232 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00971431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 276 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1138  ABC transporter related  29.94 
 
 		 547 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  28.99 
 
 		 501 aa  180  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0808  ABC transporter related  31.45 
 
 		 604 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  45.98 
 
 		 237 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2089  ABC transporter related protein  29.9 
 
 		 514 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  43.72 
 
 		 247 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  28.78 
 
 		 501 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  42.26 
 
 		 244 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>