More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3805 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_3805  ABC transporter related protein  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1318  ABC transporter related protein  49.38 
 
 
242 aa  240  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 
489 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  42.86 
 
 
502 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  42.86 
 
 
494 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  45.04 
 
 
240 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  46.36 
 
 
608 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  41.91 
 
 
501 aa  204  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  44.44 
 
 
594 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  39.42 
 
 
284 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
589 aa  201  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  44.17 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  41.08 
 
 
502 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  43.28 
 
 
490 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  41.42 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.7 
 
 
594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  43.7 
 
 
594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  44.22 
 
 
594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  43.7 
 
 
594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  44.22 
 
 
594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.7 
 
 
594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.7 
 
 
594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.7 
 
 
594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.7 
 
 
594 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  39.05 
 
 
284 aa  199  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  40 
 
 
302 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  44.22 
 
 
594 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  44.22 
 
 
594 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  42.69 
 
 
617 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  42.13 
 
 
275 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  42.13 
 
 
275 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  42.86 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  38.72 
 
 
307 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  43.82 
 
 
594 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  43.7 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1506  ABC transporter related  43.13 
 
 
595 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55626  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  43.82 
 
 
594 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  42.35 
 
 
255 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  43.53 
 
 
594 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  41.86 
 
 
593 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  43.89 
 
 
594 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  43.43 
 
 
594 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  42.91 
 
 
259 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  42.64 
 
 
589 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3362  inner-membrane translocator:ABC transporter related  41.35 
 
 
613 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270874  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  43.89 
 
 
594 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
256 aa  192  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.16 
 
 
265 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
256 aa  192  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  42.35 
 
 
254 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  42 
 
 
255 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  40.71 
 
 
257 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  41.08 
 
 
242 aa  190  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  40.82 
 
 
242 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  39.04 
 
 
598 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 
239 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  43.46 
 
 
589 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  43.15 
 
 
590 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  41.25 
 
 
283 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  40.36 
 
 
608 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  40.36 
 
 
608 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  43.2 
 
 
256 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  41.6 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  41.25 
 
 
293 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  42.23 
 
 
272 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  41.6 
 
 
239 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  40.98 
 
 
244 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  42.28 
 
 
237 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  40.55 
 
 
251 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  39.69 
 
 
271 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
239 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1163  ABC transporter related  37.4 
 
 
255 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  44.18 
 
 
951 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  39.68 
 
 
258 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
248 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  38.96 
 
 
270 aa  185  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  40.98 
 
 
246 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 
239 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  41.6 
 
 
239 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3819  ABC transporter related  42.8 
 
 
262 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0171499  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  43.8 
 
 
244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  42.4 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  40.54 
 
 
589 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1745  ABC transporter related  42.42 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  40 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  42.25 
 
 
597 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  39.38 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  43.39 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  39.92 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  41.5 
 
 
261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  41.9 
 
 
255 aa  182  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  41.18 
 
 
588 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2874  ABC transporter related  40.87 
 
 
604 aa  182  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.20768  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.46 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  41.6 
 
 
239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  42.57 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  39.68 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>