More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0067 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0067  ABC transporter related  100 
 
 		 502 aa  1000    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1818  ABC transporter related  79.68 
 
 		 501 aa  801    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.013948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  75.66 
 
 		 489 aa  750    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0485  ABC transporter related  70.72 
 
 		 490 aa  690    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4765  ABC transporter related  90.84 
 
 		 502 aa  900    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.991546  normal  0.372054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  75.05 
 
 		 494 aa  732    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  42.29 
 
 		 823 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  42.47 
 
 		 827 aa  333  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  40.9 
 
 		 822 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  41.88 
 
 		 823 aa  329  8e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  37.97 
 
 		 832 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  38.96 
 
 		 484 aa  293  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  38.75 
 
 		 828 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  39.1 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  38.96 
 
 		 852 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  36.85 
 
 		 830 aa  282  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  36.49 
 
 		 549 aa  280  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  38.54 
 
 		 505 aa  276  5e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  36.38 
 
 		 838 aa  276  8e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  36.06 
 
 		 842 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  36.11 
 
 		 863 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  35.2 
 
 		 859 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  39.5 
 
 		 504 aa  266  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  37.72 
 
 		 840 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  36.14 
 
 		 840 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  34.67 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3584  ABC transporter related  36.48 
 
 		 873 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282341  normal  0.46326 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  35.21 
 
 		 840 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1317  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 238 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1318  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 242 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  45.57 
 
 		 247 aa  206  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  49.78 
 
 		 233 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1353  ABC transporter related protein  32.51 
 
 		 516 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  32.14 
 
 		 510 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  32.93 
 
 		 508 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  31.52 
 
 		 504 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  47.16 
 
 		 246 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  48.42 
 
 		 247 aa  202  9e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 		 247 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3805  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 261 aa  200  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0383  ABC transporter related  51.8 
 
 		 241 aa  200  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 247 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  46.12 
 
 		 249 aa  199  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.76 
 
 		 235 aa  197  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  48.86 
 
 		 234 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0359  ABC transporter related  48.39 
 
 		 233 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  28.95 
 
 		 501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  50.46 
 
 		 240 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 235 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  48.21 
 
 		 237 aa  196  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  50.46 
 
 		 240 aa  196  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  46.29 
 
 		 236 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3804  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 247 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0651651  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  47.75 
 
 		 239 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  30.96 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  41.74 
 
 		 236 aa  193  6e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 233 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7087  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 241 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  46.15 
 
 		 233 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3051  ABC transporter related  31.06 
 
 		 511 aa  193  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3857  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.78 
 
 		 237 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  31.73 
 
 		 544 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  45.5 
 
 		 233 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0783  ABC transporter related  31.98 
 
 		 558 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  28.66 
 
 		 501 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  29.85 
 
 		 496 aa  192  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4147  ABC transporter related  33.07 
 
 		 524 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  43.1 
 
 		 233 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  34.09 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  46.15 
 
 		 247 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  40.62 
 
 		 237 aa  190  4e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  28.18 
 
 		 501 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  48.2 
 
 		 234 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2298  ABC transporter related  50.23 
 
 		 234 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.644067  normal  0.429574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 234 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  46.02 
 
 		 235 aa  190  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5743  ABC transporter related  31.32 
 
 		 516 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0527  ABC transporter related  30.98 
 
 		 541 aa  189  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  44.64 
 
 		 247 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  45.09 
 
 		 247 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  31.28 
 
 		 498 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  43.1 
 
 		 233 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3268  ABC transporter related  28.16 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00516012  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04900  ATPase component of uncharacterized ABC-type transporter  31.32 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 499 aa  188  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  44.69 
 
 		 234 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  28.01 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  49.54 
 
 		 236 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 		 511 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  49.54 
 
 		 243 aa  188  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2319  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 249 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  26.39 
 
 		 496 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1993  ABC transporter related  46.4 
 
 		 239 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.535094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0608  ATPase  48.89 
 
 		 234 aa  187  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1890  ABC transporter related  46.64 
 
 		 239 aa  187  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21270  nucleoside ABC transporter ATP-binding protein  32.18 
 
 		 523 aa  187  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  28.12 
 
 		 511 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  31.21 
 
 		 508 aa  187  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1668  ABC transporter-like protein  31.64 
 
 		 529 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0834819  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>