More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2096 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  64.53 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  71.32 
 
 		 277 aa  361  9e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  54 
 
 		 262 aa  265  8.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  54.8 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  53.39 
 
 		 272 aa  258  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  51 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  53.67 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  51.97 
 
 		 260 aa  255  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  50.6 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  53.63 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  53.63 
 
 		 260 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  52.8 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  53.63 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  53.23 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  51.18 
 
 		 261 aa  250  2e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  52.14 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 353 aa  249  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  50.6 
 
 		 293 aa  249  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  52.19 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  50.4 
 
 		 257 aa  247  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  49.8 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  49.01 
 
 		 258 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  49.39 
 
 		 263 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  49.22 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  49.22 
 
 		 258 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  49.8 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  44.68 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  47.69 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  45.42 
 
 		 367 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 315 aa  230  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  41.24 
 
 		 349 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  47.01 
 
 		 555 aa  225  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  47.83 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  47.43 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  46.8 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  42.66 
 
 		 333 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  45.06 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  44.79 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  44.53 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  45.06 
 
 		 258 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.31 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.38 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  42.96 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  45.42 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  48 
 
 		 241 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  42.6 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.66 
 
 		 255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  43.87 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.14 
 
 		 255 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.87 
 
 		 255 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  44.92 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  41.34 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 256 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  43.21 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  46.03 
 
 		 589 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  42.97 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 254 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  42.58 
 
 		 255 aa  208  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  43.48 
 
 		 257 aa  208  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  43.87 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.02 
 
 		 261 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.19 
 
 		 256 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  43.39 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  43.08 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  43.48 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  42.75 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.48 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  42 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  42.03 
 
 		 598 aa  205  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  43.8 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  44.09 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  44.09 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 255 aa  205  8e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 256 aa  205  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  41.67 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  41.04 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  44.49 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0231  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  43.08 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  43.36 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 255 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 		 250 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.58 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  43.22 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  43.75 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  41.5 
 
 		 261 aa  203  4e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>