More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4896 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  100 
 
 
265 aa  531  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  64.29 
 
 
263 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  65.64 
 
 
266 aa  314  7e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  57.37 
 
 
302 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  56.57 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  56.18 
 
 
310 aa  275  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  56.57 
 
 
315 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  53.57 
 
 
327 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  52.14 
 
 
297 aa  261  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  50.4 
 
 
270 aa  257  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  52.59 
 
 
351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  48 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  48.33 
 
 
349 aa  252  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  51 
 
 
367 aa  249  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  47.39 
 
 
258 aa  249  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  51.7 
 
 
277 aa  246  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  46.18 
 
 
260 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  47.6 
 
 
258 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  47.6 
 
 
258 aa  241  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  46 
 
 
261 aa  240  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  47.24 
 
 
265 aa  240  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48.05 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  47.84 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.8 
 
 
261 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48.4 
 
 
257 aa  218  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.99 
 
 
257 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  47.2 
 
 
263 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48 
 
 
257 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48 
 
 
257 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  48 
 
 
257 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.59 
 
 
257 aa  215  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  44.44 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.18 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.8 
 
 
255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  49.01 
 
 
555 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  44.18 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  45.38 
 
 
279 aa  211  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.58 
 
 
260 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  44.58 
 
 
260 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.4 
 
 
257 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.4 
 
 
257 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  46.4 
 
 
257 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  48.19 
 
 
241 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  43.03 
 
 
259 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  47.41 
 
 
252 aa  208  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 
255 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.06 
 
 
255 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
276 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.71 
 
 
254 aa  205  8e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  45.82 
 
 
247 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.92 
 
 
333 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
255 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 
255 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.04 
 
 
251 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.65 
 
 
255 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
259 aa  202  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.31 
 
 
271 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.65 
 
 
255 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.25 
 
 
255 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.17 
 
 
260 aa  201  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  43.82 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  43.37 
 
 
255 aa  199  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.65 
 
 
255 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.36 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.36 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3830  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.96 
 
 
255 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3763  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.96 
 
 
255 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.25 
 
 
255 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.96 
 
 
255 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3752  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.96 
 
 
255 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  42.46 
 
 
283 aa  198  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3932  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.96 
 
 
255 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  42.4 
 
 
258 aa  198  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  42.86 
 
 
301 aa  198  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  44.22 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  42.69 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  41.77 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  42.8 
 
 
278 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  43.98 
 
 
280 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 
254 aa  195  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  42.91 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  43.02 
 
 
255 aa  194  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
256 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  39.63 
 
 
284 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.48 
 
 
256 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  39.26 
 
 
284 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  41.27 
 
 
275 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  41.18 
 
 
275 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  41.27 
 
 
275 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 
255 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  38.55 
 
 
256 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 
255 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0260  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
255 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  42.4 
 
 
259 aa  192  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>