More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0599 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  61.85 
 
 
272 aa  323  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.25 
 
 
260 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  62.25 
 
 
260 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  59.54 
 
 
260 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  61.85 
 
 
260 aa  318  5e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  61.45 
 
 
263 aa  315  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  59.84 
 
 
263 aa  308  4e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  61.04 
 
 
301 aa  308  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  52.19 
 
 
297 aa  248  9e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48.59 
 
 
257 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  48.39 
 
 
265 aa  231  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  49.6 
 
 
252 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  50.4 
 
 
277 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  50 
 
 
297 aa  226  4e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  47.18 
 
 
252 aa  225  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  45.42 
 
 
555 aa  223  3e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  46.8 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  45.97 
 
 
252 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  45.38 
 
 
262 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  45.2 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  44.4 
 
 
260 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  44.18 
 
 
263 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  45.38 
 
 
265 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  44.58 
 
 
258 aa  205  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  46.99 
 
 
266 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  43.2 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  45.56 
 
 
255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  43.2 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 
247 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  45.6 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  42.8 
 
 
293 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
302 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  43.67 
 
 
327 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  40.8 
 
 
248 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  42.64 
 
 
351 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  40.8 
 
 
250 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.4 
 
 
261 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  44.58 
 
 
247 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 
255 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
250 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.4 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.4 
 
 
257 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
255 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.16 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.6 
 
 
257 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 
257 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  39.2 
 
 
252 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 
257 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 
257 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  43.82 
 
 
236 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  42.4 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
256 aa  179  4e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0865  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 
257 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 
255 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 
255 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 
257 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 
257 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 
255 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 
255 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
353 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
257 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  38 
 
 
251 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  40.96 
 
 
310 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  40.71 
 
 
250 aa  176  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.8 
 
 
257 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  38.8 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.8 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  39.36 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.8 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  39.76 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  38.58 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  39.68 
 
 
271 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.8 
 
 
255 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  41.56 
 
 
367 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 
255 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
315 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  40 
 
 
603 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  40.41 
 
 
349 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  39.13 
 
 
253 aa  169  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.4 
 
 
251 aa  169  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.85 
 
 
255 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38 
 
 
255 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  38.4 
 
 
254 aa  168  7e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
255 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  39.36 
 
 
253 aa  168  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
252 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  38.19 
 
 
265 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  41.47 
 
 
261 aa  167  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  39.15 
 
 
255 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  40.08 
 
 
252 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  39.42 
 
 
260 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>