More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1229 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  100 
 
 
367 aa  751    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  88.99 
 
 
349 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  71.7 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  65.05 
 
 
310 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  68.32 
 
 
327 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  61.17 
 
 
351 aa  361  9e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  65.4 
 
 
302 aa  354  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  57.58 
 
 
353 aa  343  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  59.4 
 
 
293 aa  325  6e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  54 
 
 
263 aa  268  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  51 
 
 
265 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  47.55 
 
 
266 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  46.4 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  46.8 
 
 
260 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  46 
 
 
265 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  45.67 
 
 
258 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  45.45 
 
 
258 aa  231  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  45.67 
 
 
258 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  45.42 
 
 
297 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  46.59 
 
 
270 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
297 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  46.09 
 
 
260 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  44.66 
 
 
262 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
277 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  43.37 
 
 
257 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  42.29 
 
 
280 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  42.86 
 
 
252 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.73 
 
 
333 aa  199  7e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.87 
 
 
254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  41.96 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
259 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  40.32 
 
 
278 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.18 
 
 
302 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  39.76 
 
 
271 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  43.78 
 
 
260 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  42.17 
 
 
260 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.17 
 
 
260 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 
251 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
256 aa  192  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  42.17 
 
 
260 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
257 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  42.13 
 
 
263 aa  192  9e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  40.65 
 
 
246 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  40.57 
 
 
256 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  41.13 
 
 
247 aa  191  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  39.43 
 
 
246 aa  190  4e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.98 
 
 
250 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  42.51 
 
 
241 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  42.34 
 
 
236 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  41.8 
 
 
268 aa  189  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  42.56 
 
 
250 aa  189  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  40.48 
 
 
257 aa  189  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  38.31 
 
 
256 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  42.11 
 
 
252 aa  188  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  39.04 
 
 
272 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
256 aa  187  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  39.59 
 
 
255 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  37.27 
 
 
284 aa  186  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  39.75 
 
 
256 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  38 
 
 
255 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  39.77 
 
 
265 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  39.53 
 
 
258 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  39.77 
 
 
265 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  40.16 
 
 
252 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  41.3 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  38.21 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.96 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  39.47 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  40.98 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  42.91 
 
 
599 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  40.32 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
255 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  38.11 
 
 
254 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  39.59 
 
 
252 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  36.9 
 
 
284 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  40 
 
 
256 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  41.96 
 
 
597 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  40.56 
 
 
273 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  39.53 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  39.26 
 
 
251 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  38 
 
 
255 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  41.15 
 
 
555 aa  182  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  39.3 
 
 
286 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 
255 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
255 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
255 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  43.13 
 
 
951 aa  182  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  40.49 
 
 
255 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  40.55 
 
 
301 aa  182  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  39.26 
 
 
256 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 
255 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 
255 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  39.44 
 
 
261 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40 
 
 
265 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
255 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  37.41 
 
 
275 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 
254 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  40.08 
 
 
251 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  39.02 
 
 
256 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>