More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1093 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  100 
 
 		 555 aa  1112    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  32.43 
 
 		 823 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  32.67 
 
 		 852 aa  251  3e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  31.59 
 
 		 822 aa  250  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  32.2 
 
 		 842 aa  249  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  34.21 
 
 		 573 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  29.86 
 
 		 830 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  32.43 
 
 		 823 aa  239  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  30.62 
 
 		 840 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  31.17 
 
 		 827 aa  236  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  49 
 
 		 262 aa  233  6e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  31.71 
 
 		 484 aa  233  6e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  31.18 
 
 		 859 aa  233  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  30.37 
 
 		 840 aa  229  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  47.01 
 
 		 297 aa  226  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0382  ABC transporter related  32.04 
 
 		 538 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  48.44 
 
 		 239 aa  223  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  45.79 
 
 		 279 aa  223  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48.44 
 
 		 257 aa  223  9e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 277 aa  219  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  46.8 
 
 		 297 aa  217  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3456  ABC transporter related  35.43 
 
 		 1302 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.66499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  44.81 
 
 		 236 aa  212  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  29.48 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1938  ABC transporter related  30.02 
 
 		 494 aa  210  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323376  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.28 
 
 		 293 aa  209  8e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  49.01 
 
 		 265 aa  209  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  42.86 
 
 		 272 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  30.34 
 
 		 828 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  28.72 
 
 		 863 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  30.09 
 
 		 840 aa  204  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  30.67 
 
 		 838 aa  203  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4092  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 		 489 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126474 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  43.43 
 
 		 301 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  43.02 
 
 		 263 aa  201  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  43.37 
 
 		 260 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  43.2 
 
 		 258 aa  199  7e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 266 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.37 
 
 		 260 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 353 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  42.53 
 
 		 263 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  42.91 
 
 		 263 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  43.37 
 
 		 260 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  44.35 
 
 		 241 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  29.81 
 
 		 504 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 351 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  42.17 
 
 		 270 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  42.91 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  39.93 
 
 		 310 aa  193  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  43.2 
 
 		 252 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  41.77 
 
 		 260 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  40.78 
 
 		 265 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  43.03 
 
 		 247 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  40.86 
 
 		 259 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 302 aa  190  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  40.78 
 
 		 264 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  40.15 
 
 		 349 aa  189  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  41.53 
 
 		 250 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 315 aa  187  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  41.2 
 
 		 260 aa  186  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  40 
 
 		 271 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  40.56 
 
 		 258 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  40.56 
 
 		 258 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  41.27 
 
 		 252 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  38.26 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3389  ABC transporter related  41.6 
 
 		 261 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  40.4 
 
 		 261 aa  184  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  40.48 
 
 		 252 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.78 
 
 		 265 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.96 
 
 		 255 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.82 
 
 		 255 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  40.93 
 
 		 276 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  38.19 
 
 		 257 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.82 
 
 		 255 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  40.08 
 
 		 248 aa  182  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  40.96 
 
 		 259 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4468  ABC transporter related  40.55 
 
 		 258 aa  182  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 250 aa  181  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  40.87 
 
 		 252 aa  181  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  40.08 
 
 		 603 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 254 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6413  ABC transporter related  39.06 
 
 		 261 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00239235  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6646  ABC transporter related  39.06 
 
 		 261 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0373686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 255 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  42.04 
 
 		 252 aa  180  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  39.84 
 
 		 252 aa  180  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.04 
 
 		 255 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  40.08 
 
 		 268 aa  179  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.04 
 
 		 255 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  40.33 
 
 		 252 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.65 
 
 		 255 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  39.29 
 
 		 254 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  39.29 
 
 		 254 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 		 234 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.65 
 
 		 255 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  36.33 
 
 		 288 aa  177  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 255 aa  177  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  38.62 
 
 		 246 aa  177  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  38.34 
 
 		 256 aa  177  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  41.48 
 
 		 234 aa  177  6e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>