More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3931 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  100 
 
 		 301 aa  610  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  82.75 
 
 		 260 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  81.99 
 
 		 263 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  81.71 
 
 		 260 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  81.25 
 
 		 260 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  81.25 
 
 		 260 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  83.53 
 
 		 263 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  60.45 
 
 		 272 aa  348  5e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  61.04 
 
 		 279 aa  317  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  53.67 
 
 		 297 aa  265  8.999999999999999e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  49 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  49.2 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  45.83 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  44.75 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  46.77 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  43.41 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  43.41 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  50 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  52 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  46.09 
 
 		 261 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 263 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  44.44 
 
 		 260 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  43.55 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.02 
 
 		 247 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  43.41 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  46.09 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  42.34 
 
 		 252 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  43.45 
 
 		 555 aa  205  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  42.52 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  41.77 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 266 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  40.37 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  42.42 
 
 		 603 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 256 aa  195  7e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  42.63 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 265 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.8 
 
 		 255 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  41.67 
 
 		 248 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  42.63 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 256 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  40.62 
 
 		 252 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  41.34 
 
 		 254 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  40.94 
 
 		 367 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  38.79 
 
 		 349 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 353 aa  188  9e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  38.65 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  41.37 
 
 		 241 aa  186  4e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  41.34 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  40.64 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  38.58 
 
 		 253 aa  185  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  40.24 
 
 		 257 aa  185  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  39.2 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  39.29 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  40.64 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  37.6 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  37.85 
 
 		 250 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  41.5 
 
 		 259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  41.06 
 
 		 255 aa  181  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  39.29 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  37.75 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  39.44 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  39.44 
 
 		 260 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  41.06 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  37.35 
 
 		 250 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  38.8 
 
 		 254 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.57 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 255 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  38.4 
 
 		 253 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  37.89 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  41.63 
 
 		 257 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 255 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  38.89 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  37.65 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  37.3 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.14 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.65 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 		 255 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  37.94 
 
 		 258 aa  177  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  38.43 
 
 		 254 aa  177  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  39 
 
 		 276 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  36.55 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3658  ABC transporter related  38.4 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  40.4 
 
 		 239 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  36.22 
 
 		 263 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  38.65 
 
 		 255 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 254 aa  175  7e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  38.91 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>