More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3414 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  100 
 
 		 255 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  62.9 
 
 		 252 aa  293  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  56.85 
 
 		 252 aa  277  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  56.05 
 
 		 252 aa  272  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  44.94 
 
 		 270 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  46.28 
 
 		 258 aa  216  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  43.82 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  43.82 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  44.13 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  45.56 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  43.62 
 
 		 260 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  41.5 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  42.91 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.68 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  41.53 
 
 		 260 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  42.57 
 
 		 265 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  41.94 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  40.73 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  43.72 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  42.39 
 
 		 261 aa  198  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.13 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  41.13 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  43.2 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.46 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  43.97 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  45.34 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  42.63 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  40.49 
 
 		 367 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  40.82 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  40.49 
 
 		 603 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  42.46 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  38.87 
 
 		 349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  40.32 
 
 		 555 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  40.32 
 
 		 327 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  40.49 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  39.43 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4426  ABC transporter related  40.49 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 266 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 		 336 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  38.71 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  40.65 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 351 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  41.13 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  37.55 
 
 		 262 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  37.55 
 
 		 262 aa  174  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8310  ABC transporter related  39.11 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.575602 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  38.06 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  38.87 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  40.73 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  40.08 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  37.65 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  37.55 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  38.87 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  41.8 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  39.27 
 
 		 279 aa  171  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  37.4 
 
 		 316 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  39.11 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  38.87 
 
 		 333 aa  171  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  38.84 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  38.25 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  38.58 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  37.4 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  36.86 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  39.27 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1068  ABC-transporter ATP-binding protein  35.08 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  37.25 
 
 		 250 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  38.62 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  37.45 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  37.45 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  36.8 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  37.65 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  36.44 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1827  ABC transporter related  40.56 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.754325  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  36.65 
 
 		 258 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  36.44 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  37.55 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  38.4 
 
 		 268 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  36.69 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  37.3 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  37.55 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  37.5 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  36.25 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6413  ABC transporter related  40.34 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00239235  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  36.25 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6646  ABC transporter related  40.34 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0373686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  36.65 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  40.4 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  38.34 
 
 		 251 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 247 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.55 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  36.76 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  36.9 
 
 		 315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>