More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1545 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  483  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  64.68 
 
 		 252 aa  325  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  64.29 
 
 		 252 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  62.9 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  49.6 
 
 		 279 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  46.61 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  45.34 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  48.4 
 
 		 257 aa  224  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  46.15 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  45.16 
 
 		 263 aa  222  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  46.15 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  46.15 
 
 		 258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 263 aa  218  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  46.77 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  45.12 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  46.28 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.75 
 
 		 293 aa  214  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  46.09 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  44.72 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 265 aa  211  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  42.4 
 
 		 262 aa  211  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  44.35 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.35 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.74 
 
 		 260 aa  207  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  43.21 
 
 		 261 aa  206  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  48.19 
 
 		 266 aa  204  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  42.91 
 
 		 302 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  44 
 
 		 277 aa  201  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  41.04 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  43.85 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  43.37 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  42.4 
 
 		 555 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  45.85 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  41.32 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  42.11 
 
 		 603 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  44 
 
 		 247 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  40.08 
 
 		 310 aa  185  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  42.29 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  40.56 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  40.56 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.18 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 353 aa  181  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  40 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  41.3 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  41.2 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  39.34 
 
 		 367 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  43.32 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  41.2 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  40.96 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  42.52 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1827  ABC transporter related  42.57 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.754325  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  39.27 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  40.49 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4468  ABC transporter related  41.83 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  38.11 
 
 		 349 aa  178  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  39.29 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  42.35 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.6 
 
 		 257 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  40.08 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  41.37 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  40.8 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  37.65 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  39.92 
 
 		 261 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  42.74 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  42.8 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  40.08 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  38.46 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  40.87 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.77 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  40.87 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  37.65 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  39.76 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  42.4 
 
 		 237 aa  173  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  39.2 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  38.46 
 
 		 255 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  40.8 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  39.2 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3351  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.836649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  41.13 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  39.27 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  40.48 
 
 		 264 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.87 
 
 		 258 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 257 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.08 
 
 		 257 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>