More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0315 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  502  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  77.55 
 
 
246 aa  395  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  57.55 
 
 
247 aa  299  3e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  57.14 
 
 
247 aa  298  8e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  46.56 
 
 
253 aa  237  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  44.18 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  46.96 
 
 
254 aa  217  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  44.22 
 
 
255 aa  209  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  44.05 
 
 
255 aa  208  7e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  42.45 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
297 aa  199  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  41.56 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  41.83 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
277 aa  195  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  39.37 
 
 
270 aa  192  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  39.43 
 
 
367 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  38.21 
 
 
349 aa  190  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.91 
 
 
250 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  41.53 
 
 
258 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  41.53 
 
 
258 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  38.37 
 
 
351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  41.2 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  45.04 
 
 
242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  40.08 
 
 
262 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
315 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  40.24 
 
 
264 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  39.68 
 
 
255 aa  180  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  39.2 
 
 
265 aa  180  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.64 
 
 
265 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  39.11 
 
 
256 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  37.4 
 
 
256 aa  178  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  39.6 
 
 
261 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
252 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  38.96 
 
 
327 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  45.45 
 
 
241 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  38.87 
 
 
258 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  37.69 
 
 
284 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  36.65 
 
 
259 aa  175  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
259 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  37.69 
 
 
284 aa  174  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  44.63 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  45.04 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  38.87 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  38.87 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  37.35 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  39 
 
 
258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  40.33 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.27 
 
 
250 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  38.06 
 
 
250 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  40.16 
 
 
255 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 
293 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  38.8 
 
 
263 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  40.32 
 
 
259 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 
256 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
248 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  38.06 
 
 
250 aa  171  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 
256 aa  171  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
260 aa  171  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  38.87 
 
 
262 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  38.06 
 
 
256 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  38.06 
 
 
283 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  37.25 
 
 
257 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  38.46 
 
 
256 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  37.65 
 
 
333 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  39 
 
 
251 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
255 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  39.52 
 
 
271 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  39.52 
 
 
261 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  39.11 
 
 
255 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  36.86 
 
 
273 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  39.68 
 
 
252 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  41.91 
 
 
611 aa  168  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  38.46 
 
 
260 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  36.8 
 
 
261 aa  168  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  37.15 
 
 
258 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  37.35 
 
 
256 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  36.55 
 
 
310 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  36.33 
 
 
288 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  37.65 
 
 
274 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  36.69 
 
 
353 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  36.4 
 
 
263 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
302 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  39.52 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  36.55 
 
 
263 aa  166  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  37.92 
 
 
593 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  39.17 
 
 
603 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  39.27 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  36.84 
 
 
275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  40 
 
 
611 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  36.93 
 
 
555 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  36.84 
 
 
275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  36.84 
 
 
275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  41.25 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  37.5 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  39.51 
 
 
244 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  37.05 
 
 
265 aa  164  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>