More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1502 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  72.76 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  57.55 
 
 		 246 aa  299  3e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  59.59 
 
 		 246 aa  296  2e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  51.41 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  51.98 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  48.61 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  47.43 
 
 		 255 aa  218  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  45.63 
 
 		 254 aa  215  4e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  41.43 
 
 		 351 aa  194  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  40.24 
 
 		 297 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  40.73 
 
 		 349 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 297 aa  192  3e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  41.13 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  39.76 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  39.92 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  42.75 
 
 		 265 aa  185  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  38.96 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  38.96 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 315 aa  181  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  38.31 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  40.32 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  40.16 
 
 		 310 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  37.94 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  38.96 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  41.27 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  45.68 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  45.27 
 
 		 242 aa  176  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  40.73 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  37.7 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  44.03 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  40.56 
 
 		 599 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  44.44 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  36.65 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  41 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  36.9 
 
 		 261 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  36.11 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  36.69 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  37.35 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  37.85 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  36.29 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5665  ABC transporter related  40.98 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  37.4 
 
 		 274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  37.55 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  38.96 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  40.32 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  39.68 
 
 		 608 aa  166  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  38.71 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2202  ABC transporter related  40.32 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  37.8 
 
 		 555 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  38.93 
 
 		 593 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  39.11 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  36.25 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  39.76 
 
 		 590 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  38.34 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  36.73 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0854  ABC transporter related  38.11 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 248 aa  161  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  38.15 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  35.08 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  38.25 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0476  ABC transporter related  37.3 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.615682  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  35.16 
 
 		 284 aa  161  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  37.05 
 
 		 294 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 589 aa  160  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  39.58 
 
 		 261 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  35.82 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  39.43 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  40 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  38.15 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  39.83 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  35.86 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  40.25 
 
 		 624 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  36.4 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.34 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  36.29 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  39.36 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  39.36 
 
 		 594 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  35.29 
 
 		 277 aa  158  6e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  35.16 
 
 		 284 aa  158  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  39.17 
 
 		 241 aa  159  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  40.16 
 
 		 253 aa  158  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>