More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1763 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  510  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  83.92 
 
 
255 aa  443  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  82.54 
 
 
254 aa  431  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  80.31 
 
 
255 aa  423  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  48.22 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  47.06 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  44.88 
 
 
253 aa  229  4e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  47.64 
 
 
247 aa  217  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  46.96 
 
 
246 aa  217  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  45.63 
 
 
247 aa  215  4e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.29 
 
 
257 aa  200  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  40 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  45.85 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  43.08 
 
 
258 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  43.08 
 
 
258 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
259 aa  193  3e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  40 
 
 
262 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  39.37 
 
 
297 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  41.96 
 
 
265 aa  190  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  40.62 
 
 
259 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  39.77 
 
 
272 aa  188  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  39.22 
 
 
270 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  38.82 
 
 
255 aa  185  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  37.5 
 
 
261 aa  184  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  38.43 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  41.34 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  38.1 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
351 aa  182  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  38.98 
 
 
270 aa  181  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5665  ABC transporter related  38.96 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  36.47 
 
 
255 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  40.55 
 
 
263 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  37.5 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
265 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  40.55 
 
 
260 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  39.76 
 
 
260 aa  178  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  41.5 
 
 
260 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  39.06 
 
 
260 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  40 
 
 
256 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  42.29 
 
 
252 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  37.4 
 
 
262 aa  177  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  42.29 
 
 
252 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  35.43 
 
 
261 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
277 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  37.55 
 
 
254 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  39.43 
 
 
327 aa  175  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.16 
 
 
260 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  40.16 
 
 
260 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  38.49 
 
 
555 aa  174  9e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  36.5 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  38.98 
 
 
263 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  39.76 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  36.61 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  40 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
353 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  35.8 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  36.08 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
260 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2040  ABC transporter related  38.19 
 
 
278 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222981  normal  0.58442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0854  ABC transporter related  37.2 
 
 
267 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  37.94 
 
 
315 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  37.11 
 
 
255 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  38.37 
 
 
249 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 
256 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 
652 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2181  ABC branched-chain amino acid transporter, fused ATPase and inner-membrane subunits  39.76 
 
 
652 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  37.25 
 
 
262 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  39.02 
 
 
263 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  39.29 
 
 
367 aa  168  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  36.25 
 
 
256 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  37.55 
 
 
258 aa  168  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  38.1 
 
 
349 aa  168  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  39.76 
 
 
652 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  37.5 
 
 
257 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
255 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  37.11 
 
 
265 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  36.22 
 
 
265 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.64 
 
 
262 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  36.47 
 
 
253 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  36.72 
 
 
264 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  39.15 
 
 
279 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  36.65 
 
 
256 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  35.86 
 
 
256 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  35.29 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  37.55 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  37.94 
 
 
276 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  35.86 
 
 
256 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  34.25 
 
 
268 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.25 
 
 
257 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.25 
 
 
259 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  36.76 
 
 
250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  37.11 
 
 
257 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  36.72 
 
 
261 aa  164  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  36.61 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  35.97 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.3 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  37.4 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2141  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0558111  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0775  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>