More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0824 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  72.76 
 
 		 247 aa  366  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  59.18 
 
 		 246 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  57.14 
 
 		 246 aa  298  8e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  48.22 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  47.64 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  48.05 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  47.43 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  47.1 
 
 		 255 aa  211  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  41.2 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  39.52 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  38.89 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  39.36 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  40 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  40 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  38.55 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  41.94 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 353 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  37.05 
 
 		 261 aa  174  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  45.49 
 
 		 242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  38.19 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  44.26 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  37.45 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 302 aa  171  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  36.36 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  40.32 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  39.06 
 
 		 293 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  37.15 
 
 		 367 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  37.2 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  39.44 
 
 		 261 aa  168  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  37.01 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  38.06 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  37.45 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  40 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  36.95 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  43.85 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.16 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 315 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  37.04 
 
 		 268 aa  165  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 256 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  36.51 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  38.49 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  37.35 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  39.43 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  37.6 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  38.8 
 
 		 260 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  39.68 
 
 		 252 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  37.65 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 589 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  34.14 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  41.8 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  39.27 
 
 		 590 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  37.3 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  34.4 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  39.84 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  39.68 
 
 		 608 aa  160  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  36.25 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  33.58 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  35.34 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  36.36 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  39.68 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  34.92 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  37.6 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  38.15 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  41.32 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  37.85 
 
 		 612 aa  159  5e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  36.03 
 
 		 268 aa  158  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.94 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  37.6 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.6 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  33.73 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  36.9 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  36 
 
 		 263 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1000  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  35.74 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.736788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  38.96 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  36.44 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  38.78 
 
 		 555 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  34.25 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  38.8 
 
 		 590 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  38.15 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  32.48 
 
 		 284 aa  155  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  36.55 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  37.1 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  38.55 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.6 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  36.25 
 
 		 599 aa  155  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  34.9 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 276 aa  154  9e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>