More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0447 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  82.54 
 
 		 254 aa  431  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  81.82 
 
 		 255 aa  429  1e-119  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  81.42 
 
 		 255 aa  421  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  46.64 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  48.02 
 
 		 261 aa  231  6e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  45.45 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  48.61 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  44.18 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  47.43 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.86 
 
 		 257 aa  204  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  42.91 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  40.32 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  40.62 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  41.43 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  40.87 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  40.87 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 315 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 297 aa  182  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  39.69 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  40.64 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  37.7 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  37.55 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  36.96 
 
 		 262 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  43.32 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  39.13 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  37.3 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  39.53 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  40.16 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  37.45 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  37.01 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  41.34 
 
 		 266 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  36.9 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  38.65 
 
 		 310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  37.7 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5665  ABC transporter related  38.31 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.74 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  37.3 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  38.74 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  38.74 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  37.05 
 
 		 349 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 353 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  38.74 
 
 		 261 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  38.25 
 
 		 367 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.94 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  36.36 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  38.65 
 
 		 555 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  37.45 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  38.1 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  37.5 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2610  ABC transporter related  36.22 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  36.51 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1406  ABC transporter related  36.11 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  37.86 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  39.13 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  36.19 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1481  ABC transporter related  34.24 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  41.04 
 
 		 243 aa  168  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  37.74 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  38.49 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  40.48 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  40.48 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  35.32 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  36.76 
 
 		 259 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  36.76 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0854  ABC transporter related  36.4 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  35 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  38.58 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  37.8 
 
 		 236 aa  165  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  36.96 
 
 		 261 aa  164  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  35.71 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  36.51 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  35.66 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1401  ABC transporter related  36.51 
 
 		 252 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  0.617202 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  38.52 
 
 		 279 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4944  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.956348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  38.1 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0654  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  36.76 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  35.29 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.11 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2040  ABC transporter related  35.83 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222981  normal  0.58442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  34.13 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  38.1 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  37.74 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5271  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  35.57 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  32.94 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5016  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.836649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>