More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2890 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  100 
 
 		 353 aa  711    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  70.29 
 
 		 351 aa  401  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  66.3 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  66.54 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  63.53 
 
 		 315 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  60.97 
 
 		 349 aa  345  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  57.58 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  64.73 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  60.67 
 
 		 293 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  53.82 
 
 		 263 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  49.6 
 
 		 260 aa  252  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  49.8 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  52.38 
 
 		 265 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  46.59 
 
 		 258 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  46.59 
 
 		 258 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  48.41 
 
 		 265 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  47.18 
 
 		 258 aa  239  8e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  50.59 
 
 		 266 aa  238  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  46.46 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  46.8 
 
 		 261 aa  232  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  46.69 
 
 		 260 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 277 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  46 
 
 		 297 aa  222  9e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  42.69 
 
 		 262 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.83 
 
 		 254 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  42.8 
 
 		 272 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  42.52 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 259 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  41.9 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  42.46 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  40.15 
 
 		 275 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  39.19 
 
 		 293 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  44.44 
 
 		 261 aa  199  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  43.78 
 
 		 257 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  44.19 
 
 		 555 aa  199  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  42.06 
 
 		 255 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  40.78 
 
 		 283 aa  199  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  40.15 
 
 		 275 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  40.15 
 
 		 275 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.17 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.4 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  41.6 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  41.94 
 
 		 250 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 256 aa  195  8.000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 239 aa  195  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.73 
 
 		 594 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  40.73 
 
 		 594 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.73 
 
 		 594 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  41.38 
 
 		 280 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  40 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  40.73 
 
 		 594 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.73 
 
 		 594 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.73 
 
 		 594 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  42.23 
 
 		 241 aa  193  4e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.73 
 
 		 594 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 254 aa  192  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  40.73 
 
 		 250 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  42 
 
 		 252 aa  192  9e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  38.8 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.86 
 
 		 265 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2309  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 271 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.937555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  40.5 
 
 		 594 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 		 255 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 255 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 257 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.37 
 
 		 255 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  38.54 
 
 		 286 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  39.68 
 
 		 255 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  42.13 
 
 		 274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  41.04 
 
 		 594 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 		 250 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 276 aa  190  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  41.04 
 
 		 594 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  40.56 
 
 		 253 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  39.76 
 
 		 256 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  41.73 
 
 		 257 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  39.92 
 
 		 255 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  41.04 
 
 		 594 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  41.04 
 
 		 594 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  39.92 
 
 		 251 aa  189  8e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  40.73 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  41.53 
 
 		 257 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  41.04 
 
 		 594 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  40.08 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  40.32 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  42.46 
 
 		 599 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  41.73 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  40.94 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  41.83 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  41.27 
 
 		 263 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  40.39 
 
 		 256 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  40.87 
 
 		 260 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19620  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.2 
 
 		 255 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00232655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>