More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1521 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  82.75 
 
 		 260 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  82.75 
 
 		 260 aa  441  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  81.96 
 
 		 260 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  84.05 
 
 		 263 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2164  ABC transporter related  80.23 
 
 		 263 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3931  ABC transporter related  82.75 
 
 		 301 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  61.3 
 
 		 272 aa  344  8e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0599  ABC transporter related  61.85 
 
 		 279 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  54.8 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  49.8 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  50.2 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  48.56 
 
 		 261 aa  238  9e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  46.59 
 
 		 260 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  45.28 
 
 		 265 aa  232  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  49.2 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 277 aa  229  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  44.98 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  44.98 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  43.82 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  44.44 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  43.2 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  43.78 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 		 247 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  45.78 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1545  ABC transporter related  42.74 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  42.13 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  43.41 
 
 		 603 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  44.18 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  42.74 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.97 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  41.94 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1114  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.96 
 
 		 256 aa  197  9e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  40.54 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  42.17 
 
 		 265 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  43.78 
 
 		 367 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  43.37 
 
 		 349 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  41.77 
 
 		 555 aa  192  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 256 aa  192  7e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1159  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.394443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  41.83 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3414  ABC transporter component  42.68 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  40.56 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  39.84 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  43.25 
 
 		 351 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  40.16 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.4 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  39.76 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  40.16 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  39.44 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  41.2 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  38.65 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  39.6 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  39.76 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  39.36 
 
 		 250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  40.16 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  40.16 
 
 		 241 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 256 aa  178  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  38.75 
 
 		 261 aa  178  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 		 255 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  39.76 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  39.76 
 
 		 254 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  38.55 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  38.96 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  39.13 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  39.13 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  38.19 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  40.65 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  38.25 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  38.49 
 
 		 289 aa  175  6e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  37.85 
 
 		 257 aa  175  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  39.76 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  40.31 
 
 		 261 aa  175  7e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.55 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  38.25 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  38.25 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  37.89 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  37.75 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.35 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  39.22 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  37.35 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  37.94 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1048  ABC transporter related  37.75 
 
 		 549 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  37.35 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  38.74 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2268  ABC transporter related  39.2 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  decreased coverage  0.00162775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  37.3 
 
 		 274 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>