More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1156 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  100 
 
 		 349 aa  713    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  88.99 
 
 		 367 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  70.57 
 
 		 315 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  65.05 
 
 		 310 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  68.32 
 
 		 327 aa  371  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  63.98 
 
 		 351 aa  358  7e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0106  ABC transporter related protein  64.64 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  60.97 
 
 		 353 aa  345  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  59.21 
 
 		 293 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 263 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  49.26 
 
 		 265 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 266 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  45.85 
 
 		 258 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  46.18 
 
 		 258 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  46.18 
 
 		 258 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  46.59 
 
 		 270 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  46 
 
 		 260 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  45.2 
 
 		 261 aa  229  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  41.24 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  45.2 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  45.42 
 
 		 260 aa  225  8e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  43.48 
 
 		 262 aa  215  8e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  41.31 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  42.57 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  40.16 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.34 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  42.29 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  40.87 
 
 		 257 aa  196  7e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  40.82 
 
 		 254 aa  196  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  40.94 
 
 		 334 aa  195  9e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  40.73 
 
 		 278 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.87 
 
 		 251 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.81 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  43.37 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  40.73 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 		 256 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 256 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 257 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2924  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.37 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1569  ABC transporter related  41.37 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.51859  normal  0.809659 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  41.22 
 
 		 252 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  41.37 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  39.44 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.98 
 
 		 250 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  40.64 
 
 		 241 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  38.21 
 
 		 246 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  39.02 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  39.85 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  39.02 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  39.02 
 
 		 246 aa  189  7e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  40.56 
 
 		 236 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 250 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  40.56 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  37.27 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  40.15 
 
 		 555 aa  188  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  38.78 
 
 		 255 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  37.9 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  43.58 
 
 		 599 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  38.4 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  41.34 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  38.34 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  38.89 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  39.13 
 
 		 258 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  41.96 
 
 		 597 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  39.34 
 
 		 252 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  38.96 
 
 		 255 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  41.39 
 
 		 268 aa  186  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  43.35 
 
 		 951 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  40.16 
 
 		 594 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  36.9 
 
 		 284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  40.57 
 
 		 257 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  40.16 
 
 		 594 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  39.75 
 
 		 256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2941  ABC transporter related  43.44 
 
 		 604 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.147552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  40.16 
 
 		 594 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  40.16 
 
 		 594 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  39.26 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.16 
 
 		 594 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  40.82 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  40.32 
 
 		 594 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  39.84 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  37.8 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  39.6 
 
 		 265 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 		 594 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 		 594 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 		 594 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 255 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 		 594 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 		 594 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 		 594 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.47 
 
 		 594 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  39.92 
 
 		 255 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.76 
 
 		 255 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.56 
 
 		 255 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>