More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1806 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1806  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.944964  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0315  ABC transporter related  77.55 
 
 
246 aa  395  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0824  ABC transporter related  59.18 
 
 
247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1502  ABC transporter related  59.59 
 
 
247 aa  296  2e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.202973  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  48.18 
 
 
253 aa  242  5e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1763  ABC transporter related  48.22 
 
 
254 aa  235  4e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0241378  hitchhiker  0.00146428 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0447  ABC transporter related  45.45 
 
 
254 aa  230  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1584  ABC transporter related  47.45 
 
 
255 aa  229  4e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0593  ABC transporter related  44.27 
 
 
255 aa  218  6e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.137046  hitchhiker  0.0000276007 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1579  ABC transporter related  45.2 
 
 
261 aa  210  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0133933  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  42.75 
 
 
297 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  42.86 
 
 
270 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
277 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
297 aa  201  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3968  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1229  ABC transporter related  40.65 
 
 
367 aa  191  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000210796 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1488  ABC transporter related protein  42.28 
 
 
259 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1974  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
315 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0931609  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1156  ABC transporter related  39.02 
 
 
349 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  40.96 
 
 
262 aa  188  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  41.6 
 
 
260 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  42.4 
 
 
250 aa  185  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1981  putative branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  40.49 
 
 
257 aa  184  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0449  ABC transporter related  46.69 
 
 
242 aa  184  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  39.27 
 
 
258 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
254 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1521  ABC transporter related  46.69 
 
 
242 aa  182  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000012745  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  39.37 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  40.8 
 
 
265 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3015  ABC transporter related  39.44 
 
 
327 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  41.3 
 
 
258 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  36.99 
 
 
256 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
250 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  41.13 
 
 
264 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  41.3 
 
 
258 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  40.65 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  38 
 
 
256 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  36.7 
 
 
284 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0845  ABC transporter related  44.86 
 
 
241 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.791281 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0546  ABC transporter related  45.87 
 
 
242 aa  177  9e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0891266  hitchhiker  0.0003203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3205  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
351 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.931836  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  38.62 
 
 
555 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  39.76 
 
 
255 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
252 aa  176  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  35.96 
 
 
284 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  40.73 
 
 
265 aa  175  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
259 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  40.89 
 
 
255 aa  175  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1521  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  39.76 
 
 
260 aa  175  6e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  38.55 
 
 
254 aa  175  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  38.65 
 
 
293 aa  174  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  39.92 
 
 
603 aa  174  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  39.27 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2205  ABC transporter related  38.31 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  41.3 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  37.45 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  37.6 
 
 
256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  38 
 
 
250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  39.68 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0222  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.04 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169611  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2890  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
353 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  38.31 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 
250 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  39.59 
 
 
244 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1422  ABC transporter related  37.6 
 
 
272 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  39.11 
 
 
259 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
256 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  41.77 
 
 
259 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  41.91 
 
 
247 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  40.24 
 
 
258 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  37.45 
 
 
257 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  40.73 
 
 
255 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  35.06 
 
 
288 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
255 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  40.08 
 
 
261 aa  170  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
255 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  40.65 
 
 
258 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  39.92 
 
 
260 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0659  ABC transporter related protein  40.15 
 
 
266 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1273  ABC transporter related  38.75 
 
 
263 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3842  ABC transporter related  39.84 
 
 
252 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
255 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.1 
 
 
255 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  37.9 
 
 
256 aa  169  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
265 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  38.06 
 
 
258 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3961  ABC transporter related  39.84 
 
 
252 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  38.06 
 
 
255 aa  168  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  41.67 
 
 
611 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5100  ABC transporter related  39.08 
 
 
286 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143244  normal  0.122241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 
248 aa  168  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0925  ABC transporter related  39.83 
 
 
260 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0463719  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3935  ABC transporter related  39.08 
 
 
285 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204208  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  38.33 
 
 
247 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
294 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  35.46 
 
 
259 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
276 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  37.9 
 
 
251 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0854  ABC transporter related  37.55 
 
 
267 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>