More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8310 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8310  ABC transporter related  100 
 
 
277 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.575602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  63.87 
 
 
272 aa  291  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  54.24 
 
 
237 aa  248  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  54.96 
 
 
244 aa  248  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3223  ABC transporter related  49.21 
 
 
573 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4736  ABC transporter related  46.77 
 
 
268 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  44.53 
 
 
258 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
256 aa  203  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  43.32 
 
 
258 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  42.8 
 
 
250 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  44.62 
 
 
252 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  45.34 
 
 
261 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4488  ABC transporter related  43.14 
 
 
624 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  40.7 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  43.72 
 
 
271 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  46.04 
 
 
823 aa  195  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  46.04 
 
 
823 aa  195  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  41.25 
 
 
255 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  41.5 
 
 
261 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  41.89 
 
 
284 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  43.82 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
248 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  40 
 
 
251 aa  194  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1981  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
249 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  42.96 
 
 
956 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  45.2 
 
 
259 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  41.11 
 
 
265 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  42.34 
 
 
257 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
250 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  45.28 
 
 
827 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  42.29 
 
 
275 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  42.29 
 
 
275 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  40.96 
 
 
250 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  42.29 
 
 
275 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4794  ABC transporter related  41.9 
 
 
259 aa  191  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130359  normal  0.133792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 
256 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  40.4 
 
 
256 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  40.75 
 
 
284 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0566  ABC transporter related  42.64 
 
 
277 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  42.4 
 
 
253 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4594  ABC transporter related protein  43.98 
 
 
300 aa  190  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
252 aa  190  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  42.23 
 
 
283 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 
253 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  41.73 
 
 
255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  42.02 
 
 
260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  45.61 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  40.78 
 
 
294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.32 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  41.54 
 
 
278 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
276 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 
250 aa  189  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 
293 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.16 
 
 
251 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1744  ABC transporter related  43.03 
 
 
265 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0853683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  40.71 
 
 
257 aa  189  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23020  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.78 
 
 
291 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0484452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8832  ABC transporter related  44.31 
 
 
255 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  41.37 
 
 
257 aa  188  7e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7076  high-affinity branched-chain amino acid transport protein  42.75 
 
 
265 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4552  ABC transporter related  41.63 
 
 
260 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  42.47 
 
 
593 aa  188  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  41.02 
 
 
255 aa  188  8e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  42.47 
 
 
593 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  39.93 
 
 
286 aa  187  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  40.56 
 
 
256 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  41.77 
 
 
261 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  43.78 
 
 
822 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6414  ABC transporter related  42.57 
 
 
258 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.476451  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
292 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  41.11 
 
 
294 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  40.77 
 
 
269 aa  186  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
260 aa  185  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  39.92 
 
 
259 aa  185  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0824  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.37 
 
 
257 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381559  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  43.62 
 
 
256 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  38.93 
 
 
274 aa  185  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  42.28 
 
 
334 aa  185  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.6 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  40.64 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  42.56 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.21 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  41.77 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  41.83 
 
 
333 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5665  ABC transporter related  42.8 
 
 
283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  40.64 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  39.11 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  39.41 
 
 
288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  40.95 
 
 
242 aa  183  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0787  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.77 
 
 
257 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0991  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
257 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  41.25 
 
 
257 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  39.41 
 
 
276 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0985  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
257 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000122559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2499  ABC transporter related  39.92 
 
 
262 aa  183  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.241387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  37.6 
 
 
258 aa  183  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0883  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
257 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0942  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 
257 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00114272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>