More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1975 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1975  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6115  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 
247 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.746507  normal  0.28119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  45.2 
 
 
265 aa  216  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  45.6 
 
 
264 aa  215  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  49.59 
 
 
603 aa  214  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  46.18 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3689  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  46 
 
 
293 aa  209  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  45.42 
 
 
257 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  45.6 
 
 
275 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  45.6 
 
 
275 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  45.6 
 
 
283 aa  208  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  45.6 
 
 
275 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  45.38 
 
 
260 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  43.03 
 
 
251 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1039  ABC transporter related  46.03 
 
 
270 aa  205  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.418168 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1851  ABC transporter related  43.2 
 
 
252 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28249  normal  0.201191 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  45.06 
 
 
258 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
255 aa  202  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2609  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.64 
 
 
255 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3256  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.64 
 
 
255 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1653  ABC transporter related  42.45 
 
 
248 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  44.08 
 
 
249 aa  201  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  44.35 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0909  ABC transporter related  45.04 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  44.22 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44.98 
 
 
250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  44.19 
 
 
334 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4896  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
265 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408295  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2096  ABC transporter related  44.84 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.185907  normal  0.0132496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  44 
 
 
255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  41.67 
 
 
257 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 
257 aa  198  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  44.4 
 
 
252 aa  198  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.05 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  40.64 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  40.94 
 
 
261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  39.76 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  41.2 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  41.67 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  43.65 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  44.18 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  42.75 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  42.8 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  41.8 
 
 
259 aa  196  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  45.78 
 
 
258 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  45.78 
 
 
258 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1738  ABC transporter related protein  43.65 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4426  ABC transporter related  44.09 
 
 
265 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.978838  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  43.6 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  45.97 
 
 
293 aa  195  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  42.19 
 
 
258 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  42.19 
 
 
258 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  43.43 
 
 
333 aa  194  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0505  ABC transporter related  43.95 
 
 
265 aa  194  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 
258 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  40.48 
 
 
260 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  44.31 
 
 
950 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  41.5 
 
 
271 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3088  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
297 aa  193  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4334  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.39 
 
 
255 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.231493  normal  0.133886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  41.8 
 
 
258 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  42.63 
 
 
262 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.34 
 
 
255 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  43.43 
 
 
251 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  41.37 
 
 
251 aa  191  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  38.43 
 
 
284 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1873  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.37 
 
 
263 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.188258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.34 
 
 
255 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  42.8 
 
 
242 aa  191  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  43.93 
 
 
242 aa  191  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.94 
 
 
255 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  41.56 
 
 
240 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
258 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1426  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
253 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.259365  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  41.04 
 
 
265 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.45 
 
 
255 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  43.03 
 
 
555 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.34 
 
 
255 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4111  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.11 
 
 
255 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.277717  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  41.37 
 
 
259 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  38.43 
 
 
284 aa  190  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  40.16 
 
 
259 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  45.78 
 
 
252 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1085  ABC transporter related  41.8 
 
 
277 aa  190  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0894019  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  43.6 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  44.13 
 
 
597 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  41.67 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  40.16 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  43.37 
 
 
254 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  44.92 
 
 
257 aa  188  7e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  40.56 
 
 
259 aa  188  7e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 
256 aa  188  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  43.25 
 
 
259 aa  188  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 
255 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  42 
 
 
255 aa  187  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4884  ABC transporter related  43.82 
 
 
260 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>