More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36839 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  100 
 
 
1761 aa  3648    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  31.51 
 
 
1415 aa  304  9e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_006686  CND01470  hypothetical protein  28.64 
 
 
1586 aa  132  6e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  26.69 
 
 
1198 aa  106  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  26.46 
 
 
1432 aa  105  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  26.09 
 
 
972 aa  95.9  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  27.7 
 
 
1127 aa  95.5  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  25.36 
 
 
849 aa  92  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  26.82 
 
 
900 aa  90.9  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  35.29 
 
 
985 aa  90.1  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  24.33 
 
 
701 aa  88.6  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  27.1 
 
 
707 aa  88.2  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  27.94 
 
 
1843 aa  88.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  24.71 
 
 
1045 aa  87.4  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  26.06 
 
 
715 aa  83.6  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  23.41 
 
 
806 aa  79.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  23.41 
 
 
1086 aa  79.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  21.66 
 
 
1277 aa  77  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  21.2 
 
 
1202 aa  75.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  35.38 
 
 
1381 aa  74.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  28.93 
 
 
1517 aa  72.8  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  35.25 
 
 
1359 aa  72.8  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 
1102 aa  72.8  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39246  ATPase component of a four subunit chromatin remodeling complex  27.91 
 
 
860 aa  72.4  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  32.08 
 
 
1130 aa  72.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 
1118 aa  72  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
982 aa  71.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  30.56 
 
 
1284 aa  70.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  34.85 
 
 
1025 aa  71.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  34.59 
 
 
1069 aa  70.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  34.59 
 
 
1069 aa  70.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 
832 aa  70.5  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  32.7 
 
 
1112 aa  70.5  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  30.07 
 
 
1159 aa  70.5  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46863  predicted protein  26.09 
 
 
1597 aa  69.3  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  28.57 
 
 
809 aa  69.3  0.0000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  33.06 
 
 
1134 aa  68.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
1261 aa  68.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  30.07 
 
 
1127 aa  68.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
1449 aa  68.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  27.89 
 
 
1222 aa  68.2  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.58 
 
 
1069 aa  68.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  32.84 
 
 
988 aa  68.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  32.05 
 
 
975 aa  68.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  31.82 
 
 
1068 aa  68.6  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  31.68 
 
 
1414 aa  68.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  33.85 
 
 
1437 aa  68.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12310  predicted protein  30.99 
 
 
140 aa  68.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.462485  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
1171 aa  67.4  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  31.82 
 
 
1068 aa  67.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 
1068 aa  67.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  31.51 
 
 
1023 aa  67.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  33.59 
 
 
977 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  30.07 
 
 
1132 aa  67.4  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  32.89 
 
 
821 aa  67  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  31.58 
 
 
993 aa  67  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  30.77 
 
 
1062 aa  66.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
1091 aa  66.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  31.06 
 
 
1080 aa  66.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 
1129 aa  65.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  31.06 
 
 
1003 aa  65.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49280  predicted protein  23.21 
 
 
2017 aa  65.9  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.83375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  33.85 
 
 
1357 aa  65.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  33.59 
 
 
1086 aa  65.9  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.03 
 
 
1143 aa  65.5  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31894  predicted protein  34.78 
 
 
1594 aa  65.1  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
1068 aa  65.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
1066 aa  65.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  30.3 
 
 
1071 aa  64.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  26.8 
 
 
1096 aa  65.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  30.77 
 
 
1354 aa  65.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82348  DNA-dependent ATPase of the nucleotide excision repair factor 4 complex  31.15 
 
 
1343 aa  64.3  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.968646  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  31.54 
 
 
1170 aa  64.7  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 
1155 aa  64.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
1112 aa  63.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
1403 aa  64.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 
1069 aa  64.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  27.91 
 
 
1150 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  31.88 
 
 
1141 aa  64.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  32.06 
 
 
291 aa  64.7  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  28.57 
 
 
959 aa  63.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.19 
 
 
964 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39168  predicted protein  30.46 
 
 
522 aa  63.9  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.129742  normal  0.87611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  33.07 
 
 
1100 aa  63.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  30.53 
 
 
1091 aa  63.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
1089 aa  63.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  28.95 
 
 
609 aa  63.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.56 
 
 
1160 aa  63.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  31.29 
 
 
1073 aa  63.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 
1055 aa  63.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  32.52 
 
 
1161 aa  62.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  32.28 
 
 
1120 aa  63.2  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  32.59 
 
 
1019 aa  63.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  31.08 
 
 
1209 aa  63.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  24.67 
 
 
1070 aa  63.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.77 
 
 
1227 aa  62.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
842 aa  62.8  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  32.93 
 
 
1073 aa  62.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  29.55 
 
 
777 aa  62.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.85 
 
 
1031 aa  62.4  0.00000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>