203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND01470 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND01470  hypothetical protein  100 
 
 		 1586 aa  3296    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  25.95 
 
 		 1415 aa  256  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1761 aa  133  3e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  30.94 
 
 		 1432 aa  116  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  24.69 
 
 		 1843 aa  95.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46863  predicted protein  24.21 
 
 		 1597 aa  82.4  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  23.26 
 
 		 1127 aa  75.1  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  35.96 
 
 		 964 aa  73.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  31.94 
 
 		 900 aa  71.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  27.21 
 
 		 1198 aa  69.3  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  23.16 
 
 		 849 aa  67.4  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  27.22 
 
 		 1181 aa  67.8  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 		 1068 aa  67  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  34.21 
 
 		 1066 aa  67  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  31.03 
 
 		 959 aa  67  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  30.66 
 
 		 1112 aa  66.6  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  35.97 
 
 		 972 aa  65.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  22.81 
 
 		 1359 aa  65.9  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  26.86 
 
 		 1170 aa  64.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  23.26 
 
 		 1045 aa  64.7  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  32.76 
 
 		 985 aa  64.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  29.75 
 
 		 1096 aa  63.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49280  predicted protein  30.07 
 
 		 2017 aa  64.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.83375  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 982 aa  63.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  32.46 
 
 		 977 aa  62.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.34 
 
 		 1160 aa  62.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  27.46 
 
 		 1127 aa  62  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  22.51 
 
 		 1202 aa  62  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  28.08 
 
 		 1069 aa  61.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  31.9 
 
 		 1154 aa  61.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  30.7 
 
 		 1003 aa  61.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.57 
 
 		 1110 aa  60.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  24.55 
 
 		 707 aa  60.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 1069 aa  60.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  31.72 
 
 		 898 aa  60.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  22.33 
 
 		 1184 aa  60.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  28.86 
 
 		 1130 aa  60.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 		 1118 aa  60.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.97 
 
 		 1091 aa  59.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  27.59 
 
 		 1069 aa  59.7  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 1102 aa  59.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  28.87 
 
 		 939 aa  59.3  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.08 
 
 		 1068 aa  59.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  26.49 
 
 		 993 aa  58.9  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.95 
 
 		 1143 aa  58.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  26.63 
 
 		 1120 aa  58.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  33.33 
 
 		 1132 aa  58.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  29.27 
 
 		 1071 aa  58.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  28.34 
 
 		 1222 aa  58.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  19.94 
 
 		 701 aa  58.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  26.47 
 
 		 1159 aa  58.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  26.11 
 
 		 1357 aa  57.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.23 
 
 		 1112 aa  57.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49572  predicted protein  29.93 
 
 		 975 aa  57.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  27.59 
 
 		 1062 aa  57.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  27.5 
 
 		 1557 aa  57.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  27.89 
 
 		 832 aa  57.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.35 
 
 		 1089 aa  57.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  30.97 
 
 		 1068 aa  57  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  29.17 
 
 		 1284 aa  57  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  25 
 
 		 988 aa  56.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  29.57 
 
 		 1209 aa  56.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  29.57 
 
 		 1093 aa  57  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  28.99 
 
 		 1096 aa  56.6  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  26.88 
 
 		 1120 aa  56.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  29.06 
 
 		 1394 aa  56.2  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  29.84 
 
 		 1080 aa  56.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  20.46 
 
 		 1086 aa  56.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  28.3 
 
 		 746 aa  56.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 950 aa  56.2  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  30 
 
 		 1084 aa  55.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 1261 aa  55.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  26.62 
 
 		 291 aa  55.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  27.61 
 
 		 1250 aa  55.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 		 842 aa  55.5  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  25.93 
 
 		 1163 aa  55.5  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.1 
 
 		 1129 aa  55.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  20.46 
 
 		 806 aa  55.5  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  29.17 
 
 		 1141 aa  55.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 1055 aa  55.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  29.17 
 
 		 711 aa  55.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  31.58 
 
 		 727 aa  55.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  26.63 
 
 		 1025 aa  55.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  29.66 
 
 		 1437 aa  54.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  29.33 
 
 		 1084 aa  55.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50465  predicted protein  25.1 
 
 		 989 aa  55.1  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90641  transcriptional regulator  29.75 
 
 		 1414 aa  54.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.104973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  31.62 
 
 		 1161 aa  55.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 1021 aa  53.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31894  predicted protein  26.76 
 
 		 1594 aa  54.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  33.88 
 
 		 1769 aa  54.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28 
 
 		 907 aa  53.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  26.62 
 
 		 1107 aa  53.9  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01170  DNA repair protein rad8, putative  27.52 
 
 		 1856 aa  53.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  29.85 
 
 		 1164 aa  53.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  25.65 
 
 		 924 aa  53.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 1068 aa  53.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  32.5 
 
 		 1901 aa  53.5  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53653  protein required for X-ray damage repair, mitotic recombination, and full meiotic recombination. mRNA increases in meiosis  25 
 
 		 821 aa  53.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194325  normal  0.270019 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16586  predicted protein  28.48 
 
 		 983 aa  52.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>