292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45116 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  100 
 
 		 1843 aa  3821    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  32.74 
 
 		 1432 aa  208  6e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  30 
 
 		 1184 aa  109  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  30.51 
 
 		 1415 aa  102  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.671763 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  27.69 
 
 		 1132 aa  100  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_006686  CND01470  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1586 aa  96.3  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1761 aa  88.6  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  25.25 
 
 		 1202 aa  84  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  30.22 
 
 		 985 aa  83.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  30 
 
 		 701 aa  82  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  28.5 
 
 		 715 aa  80.5  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  30.57 
 
 		 964 aa  80.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  36.6 
 
 		 1359 aa  79.3  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  27.46 
 
 		 900 aa  79.3  0.0000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  36.75 
 
 		 1170 aa  79  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  33.08 
 
 		 1120 aa  78.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.94 
 
 		 1143 aa  77.4  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.72 
 
 		 1261 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  31.82 
 
 		 1159 aa  77.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.35 
 
 		 1110 aa  77.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82348  DNA-dependent ATPase of the nucleotide excision repair factor 4 complex  30.72 
 
 		 1343 aa  77  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.968646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  29.71 
 
 		 1112 aa  76.3  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01170  DNA repair protein rad8, putative  32.08 
 
 		 1856 aa  75.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.43 
 
 		 1171 aa  75.1  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  24.66 
 
 		 972 aa  74.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  28.11 
 
 		 1154 aa  75.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  32.33 
 
 		 1120 aa  75.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  28.51 
 
 		 1086 aa  74.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  23.49 
 
 		 1127 aa  74.3  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  26.54 
 
 		 1198 aa  74.3  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  31.69 
 
 		 922 aa  73.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  28.33 
 
 		 806 aa  74.7  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  31.16 
 
 		 1163 aa  73.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 		 1160 aa  73.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  27.44 
 
 		 1025 aa  73.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  30.37 
 
 		 1381 aa  72.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  27.71 
 
 		 849 aa  72.8  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 1102 aa  72.8  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  33.57 
 
 		 746 aa  72  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45071  predicted protein  29.19 
 
 		 853 aa  71.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.706986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 1089 aa  71.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  29.1 
 
 		 1357 aa  72  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1277 aa  71.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  27.67 
 
 		 1209 aa  70.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46863  predicted protein  31.15 
 
 		 1597 aa  70.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  29.88 
 
 		 609 aa  70.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  29.38 
 
 		 1045 aa  70.1  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  30.73 
 
 		 1142 aa  70.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 1091 aa  70.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.77 
 
 		 988 aa  70.1  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  29.05 
 
 		 1086 aa  70.1  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.52 
 
 		 1069 aa  70.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  28.06 
 
 		 1062 aa  70.1  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  28.09 
 
 		 918 aa  69.3  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  30.14 
 
 		 1081 aa  69.3  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 		 1129 aa  68.9  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  28.68 
 
 		 1086 aa  68.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 1164 aa  68.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  25.24 
 
 		 914 aa  68.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.97 
 
 		 1091 aa  68.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 1152 aa  67.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  29.45 
 
 		 918 aa  67.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  26.86 
 
 		 1082 aa  67.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 1118 aa  67.4  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49280  predicted protein  24.03 
 
 		 2017 aa  67.4  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.83375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  30.28 
 
 		 1127 aa  67.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  29.45 
 
 		 918 aa  67.4  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  22.15 
 
 		 1161 aa  67  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  26.86 
 
 		 1082 aa  67.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  28.47 
 
 		 1164 aa  67  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 982 aa  66.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  29.41 
 
 		 1134 aa  67  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  28 
 
 		 1141 aa  67  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  27.01 
 
 		 1082 aa  67  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  33.58 
 
 		 674 aa  65.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  29.66 
 
 		 1250 aa  65.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  39.53 
 
 		 707 aa  65.9  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 1007 aa  65.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  28.47 
 
 		 1065 aa  65.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 1449 aa  65.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  26.37 
 
 		 1070 aa  65.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  27.7 
 
 		 1386 aa  65.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  29.55 
 
 		 1068 aa  65.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  27.7 
 
 		 1362 aa  64.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01961  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10830)  31.08 
 
 		 1502 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.288064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  30.22 
 
 		 918 aa  64.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  27.62 
 
 		 1070 aa  64.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  30.22 
 
 		 918 aa  64.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  30.22 
 
 		 918 aa  64.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  30.22 
 
 		 918 aa  64.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  30.83 
 
 		 959 aa  64.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 		 1120 aa  64.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  30.46 
 
 		 918 aa  64.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.15 
 
 		 741 aa  64.7  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  30.22 
 
 		 918 aa  64.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.33 
 
 		 977 aa  64.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  27.88 
 
 		 1531 aa  64.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  29.46 
 
 		 1071 aa  64.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02973  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08400)  31.39 
 
 		 1107 aa  63.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.644071  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 		 842 aa  63.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>