161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45071 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45071  predicted protein  100 
 
 		 853 aa  1764    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.706986  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49280  predicted protein  34.3 
 
 		 2017 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.83375  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01170  DNA repair protein rad8, putative  33.7 
 
 		 1856 aa  435  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06076  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09120)  26.79 
 
 		 2379 aa  224  6e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  29.19 
 
 		 1843 aa  71.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  25 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 1102 aa  61.2  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 1112 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 1155 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  27.03 
 
 		 1154 aa  58.9  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 		 1118 aa  58.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  30.07 
 
 		 1141 aa  58.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  25.48 
 
 		 1072 aa  58.2  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  23.6 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  27.61 
 
 		 1112 aa  58.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  32.52 
 
 		 1184 aa  57.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 1160 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  29.63 
 
 		 1065 aa  56.6  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  30.72 
 
 		 663 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  31.82 
 
 		 773 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  25.69 
 
 		 922 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  25.6 
 
 		 900 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  27.85 
 
 		 1048 aa  55.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  30.49 
 
 		 1194 aa  55.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  31.21 
 
 		 1019 aa  55.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  29.61 
 
 		 1025 aa  55.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  28 
 
 		 1432 aa  55.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  30.07 
 
 		 1531 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  33.12 
 
 		 1007 aa  55.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  28.67 
 
 		 1163 aa  54.3  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  20.5 
 
 		 806 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 1089 aa  53.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.17 
 
 		 1227 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1277 aa  53.5  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.11 
 
 		 988 aa  53.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  33.13 
 
 		 903 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 		 1120 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  28.85 
 
 		 872 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 1112 aa  52.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 		 933 aa  52.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  30.14 
 
 		 1357 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  27.33 
 
 		 1120 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  28.47 
 
 		 1062 aa  52.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46863  predicted protein  29.37 
 
 		 1597 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.53 
 
 		 741 aa  52  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 1139 aa  52  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  28.85 
 
 		 1019 aa  52  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  28.08 
 
 		 1120 aa  52  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.21 
 
 		 907 aa  51.6  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1761 aa  51.6  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 1007 aa  51.6  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  28.77 
 
 		 1381 aa  51.6  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  26.05 
 
 		 1096 aa  51.6  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  28.47 
 
 		 1081 aa  51.2  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  31.94 
 
 		 1386 aa  51.2  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  31.94 
 
 		 1362 aa  51.2  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  28.48 
 
 		 918 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.48 
 
 		 914 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  30.61 
 
 		 958 aa  50.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  30.07 
 
 		 917 aa  50.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  32.04 
 
 		 1068 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 		 1048 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  29.17 
 
 		 1064 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  21.82 
 
 		 1415 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  30.26 
 
 		 1077 aa  50.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  31.61 
 
 		 1006 aa  49.7  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  31.07 
 
 		 1088 aa  50.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 1091 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  29.75 
 
 		 990 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.23 
 
 		 1099 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  30.14 
 
 		 924 aa  50.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.89 
 
 		 1067 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.35 
 
 		 1110 aa  50.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 1152 aa  50.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  25.66 
 
 		 1110 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 1171 aa  50.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  26.06 
 
 		 964 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  29.17 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  29.17 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.61 
 
 		 925 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  29.17 
 
 		 1064 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  30 
 
 		 1063 aa  49.7  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  28.77 
 
 		 1142 aa  49.3  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  26.76 
 
 		 1178 aa  49.3  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  27.69 
 
 		 1047 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  26.57 
 
 		 1071 aa  49.7  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  28.75 
 
 		 1068 aa  49.7  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.69 
 
 		 1047 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  25.17 
 
 		 1181 aa  48.9  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  29.17 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1068  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1128 aa  48.9  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  29.17 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 		 1068 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 		 1069 aa  48.9  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  25.83 
 
 		 985 aa  48.9  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  26.76 
 
 		 1003 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  29.63 
 
 		 1901 aa  48.5  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  27.97 
 
 		 918 aa  48.5  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  27.97 
 
 		 918 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  27.97 
 
 		 918 aa  48.5  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>