More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46863 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46863  predicted protein  100 
 
 		 1597 aa  3330    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  28.69 
 
 		 1202 aa  119  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  25.95 
 
 		 1198 aa  109  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  29.21 
 
 		 1127 aa  108  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  28.66 
 
 		 972 aa  108  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  27.85 
 
 		 1184 aa  105  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  26.99 
 
 		 1170 aa  97.4  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  27.56 
 
 		 900 aa  94.4  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  29.56 
 
 		 701 aa  90.9  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  26.38 
 
 		 1132 aa  88.6  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  24.74 
 
 		 715 aa  87.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  27.03 
 
 		 1848 aa  82.4  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01470  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1586 aa  82  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 		 1021 aa  81.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  28.68 
 
 		 1415 aa  80.9  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1277 aa  80.1  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  27.38 
 
 		 1111 aa  79.7  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  27.24 
 
 		 1443 aa  78.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 		 1108 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  29.63 
 
 		 1086 aa  77.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  25.16 
 
 		 1096 aa  77.4  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 898 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 		 1066 aa  77  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  31.41 
 
 		 1084 aa  76.3  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 		 1261 aa  75.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  31.9 
 
 		 1194 aa  75.5  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06076  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09120)  35.43 
 
 		 2379 aa  74.7  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  27.1 
 
 		 886 aa  75.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  25.78 
 
 		 1250 aa  74.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  30.13 
 
 		 1064 aa  74.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  26.02 
 
 		 1127 aa  73.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  29.75 
 
 		 1064 aa  73.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  33.53 
 
 		 964 aa  73.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  25.67 
 
 		 1154 aa  73.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  32.12 
 
 		 1031 aa  73.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 		 1129 aa  73.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  29.11 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 1048 aa  73.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  32.52 
 
 		 1070 aa  72.8  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  29.11 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  29.11 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  29.11 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  30.41 
 
 		 1045 aa  72.8  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  29.11 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  28.48 
 
 		 1064 aa  72.8  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  27.96 
 
 		 1078 aa  72.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 		 1073 aa  72.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 922 aa  72.4  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  30.59 
 
 		 1394 aa  72.4  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  24.81 
 
 		 1070 aa  72  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  25.4 
 
 		 1185 aa  72  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 1073 aa  72  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  27.96 
 
 		 1112 aa  72  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  24.43 
 
 		 1904 aa  71.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.95 
 
 		 1026 aa  72  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.36 
 
 		 1102 aa  71.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  24.84 
 
 		 1222 aa  72  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  27.85 
 
 		 1064 aa  71.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.36 
 
 		 1072 aa  71.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  26.27 
 
 		 621 aa  71.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  30.25 
 
 		 872 aa  70.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 848 aa  70.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 		 1068 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 1073 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  28.71 
 
 		 1100 aa  70.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  28.83 
 
 		 1432 aa  71.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  24.68 
 
 		 1006 aa  70.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 		 1074 aa  71.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 1073 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  31.75 
 
 		 1150 aa  70.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  25.16 
 
 		 977 aa  70.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  23.36 
 
 		 1084 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  29.17 
 
 		 1082 aa  70.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  26.73 
 
 		 1055 aa  70.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  31.15 
 
 		 1843 aa  70.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  31.36 
 
 		 1130 aa  70.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.52 
 
 		 1007 aa  70.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  22.99 
 
 		 1084 aa  69.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 		 966 aa  69.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  31.9 
 
 		 1082 aa  69.7  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 		 617 aa  69.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1761 aa  69.3  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  28.33 
 
 		 901 aa  69.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 		 633 aa  69.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  26.73 
 
 		 1178 aa  68.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  26.46 
 
 		 1088 aa  68.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  23.98 
 
 		 1193 aa  68.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  26.51 
 
 		 1354 aa  68.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.81 
 
 		 1155 aa  68.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  25.49 
 
 		 1007 aa  68.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 1139 aa  68.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  24.32 
 
 		 1003 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 1105 aa  68.6  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  26.9 
 
 		 1047 aa  68.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 		 1047 aa  68.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  25.23 
 
 		 956 aa  68.6  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  25.08 
 
 		 1901 aa  67.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  27.33 
 
 		 1386 aa  67.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  26.69 
 
 		 1431 aa  67.4  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  27.33 
 
 		 1362 aa  67.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>