224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_49280 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06076  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09120)  31.34 
 
 		 2379 aa  758    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01170  DNA repair protein rad8, putative  36.81 
 
 		 1856 aa  1042    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49280  predicted protein  100 
 
 		 2017 aa  4200    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.83375  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45072  predicted protein  47.7 
 
 		 947 aa  477  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45071  predicted protein  34.74 
 
 		 853 aa  465  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.706986  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  27.5 
 
 		 900 aa  92.8  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  27.53 
 
 		 715 aa  72  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  25.27 
 
 		 1415 aa  71.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.671763 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  23.61 
 
 		 1202 aa  71.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  33.11 
 
 		 1003 aa  68.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  24.19 
 
 		 1127 aa  68.9  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  27.63 
 
 		 1154 aa  67.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  24.03 
 
 		 1843 aa  67  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  23.96 
 
 		 1432 aa  66.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 1066 aa  65.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1761 aa  65.9  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 		 1261 aa  65.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  23.75 
 
 		 1100 aa  64.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01470  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1586 aa  64.3  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 		 1155 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  22.45 
 
 		 972 aa  63.9  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.2 
 
 		 1110 aa  64.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  24.42 
 
 		 701 aa  63.9  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  29.49 
 
 		 939 aa  63.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 1160 aa  63.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  25.84 
 
 		 1198 aa  63.2  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.21 
 
 		 1113 aa  62.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  23.21 
 
 		 1113 aa  62.8  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  28.03 
 
 		 1134 aa  62.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.71 
 
 		 988 aa  62  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  26.53 
 
 		 1163 aa  62  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 1102 aa  62  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  25 
 
 		 1091 aa  61.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  26.28 
 
 		 1081 aa  61.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.94 
 
 		 1031 aa  61.6  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  30.71 
 
 		 985 aa  60.5  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 1068 aa  60.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.5 
 
 		 977 aa  60.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  26.82 
 
 		 959 aa  59.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  30.34 
 
 		 1112 aa  60.1  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  29.52 
 
 		 1025 aa  60.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  29.03 
 
 		 1130 aa  60.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  29.58 
 
 		 291 aa  59.7  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  30.71 
 
 		 964 aa  59.3  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 		 982 aa  59.3  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  26.21 
 
 		 1141 aa  59.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  31.5 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  29.14 
 
 		 1381 aa  59.3  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  27.97 
 
 		 1132 aa  58.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  29.75 
 
 		 832 aa  58.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  26.9 
 
 		 1184 aa  58.2  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  31.29 
 
 		 1357 aa  57.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 1118 aa  57.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  23.79 
 
 		 663 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.38 
 
 		 1227 aa  57.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 1104 aa  57  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 		 490 aa  56.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  22.98 
 
 		 1086 aa  56.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  23.39 
 
 		 773 aa  56.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  29.6 
 
 		 872 aa  56.2  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 1171 aa  56.2  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  28.46 
 
 		 918 aa  55.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 1073 aa  55.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.46 
 
 		 914 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  27.75 
 
 		 1354 aa  55.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  27.86 
 
 		 1082 aa  55.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 1073 aa  55.5  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 1073 aa  54.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 1139 aa  54.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 		 1449 aa  54.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  26.17 
 
 		 1159 aa  54.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.17 
 
 		 1102 aa  55.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.1 
 
 		 907 aa  54.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  30.23 
 
 		 1277 aa  54.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  21.54 
 
 		 1045 aa  54.3  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  26.37 
 
 		 1126 aa  54.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  26.83 
 
 		 385 aa  54.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 1089 aa  54.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  27.86 
 
 		 1082 aa  55.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  27.86 
 
 		 1082 aa  55.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.92 
 
 		 1073 aa  55.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  26.83 
 
 		 385 aa  54.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 876 aa  55.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  32.56 
 
 		 1698 aa  53.9  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  27.21 
 
 		 1250 aa  53.9  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  27.94 
 
 		 1084 aa  53.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 		 842 aa  53.5  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  30 
 
 		 896 aa  53.5  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  27.94 
 
 		 1084 aa  53.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  28.06 
 
 		 1071 aa  53.5  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  27.14 
 
 		 1326 aa  53.1  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 1129 aa  53.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  27.54 
 
 		 1359 aa  53.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 		 1021 aa  53.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  26.92 
 
 		 1073 aa  53.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  29.58 
 
 		 1006 aa  53.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  31.21 
 
 		 901 aa  53.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 1055 aa  52.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.54 
 
 		 971 aa  52.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  28.79 
 
 		 1437 aa  52.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>