287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0817 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
385 aa  775    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
385 aa  775    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  57.29 
 
 
380 aa  401  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  52.14 
 
 
390 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  50.94 
 
 
390 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24513  predicted protein  31.23 
 
 
820 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.558259  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25785  predicted protein  32.12 
 
 
778 aa  132  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00893206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
490 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  29.47 
 
 
315 aa  124  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  31.42 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.84 
 
 
437 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  38.55 
 
 
483 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  35.84 
 
 
423 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 
324 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  35.26 
 
 
423 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.01 
 
 
305 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  32.32 
 
 
727 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  27.54 
 
 
657 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  31.06 
 
 
331 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  29.79 
 
 
338 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  36.65 
 
 
416 aa  98.6  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.37 
 
 
451 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  29.86 
 
 
438 aa  97.8  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  33.71 
 
 
329 aa  97.8  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.27 
 
 
313 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.07 
 
 
435 aa  95.5  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.42 
 
 
283 aa  95.9  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  32.1 
 
 
311 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  29.58 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.5 
 
 
328 aa  95.1  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25721  predicted protein  30.48 
 
 
848 aa  94  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.185267  normal  0.216666 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.69 
 
 
319 aa  94  5e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
460 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
460 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  35.8 
 
 
419 aa  89.7  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  32.72 
 
 
327 aa  89.4  1e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.38 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  31.06 
 
 
335 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.15 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 
313 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.57 
 
 
357 aa  87.8  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.74 
 
 
406 aa  87.4  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  35.12 
 
 
395 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.05 
 
 
313 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  32.88 
 
 
487 aa  87  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
350 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  35.19 
 
 
535 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  34.15 
 
 
467 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
719 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
719 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  30.82 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  34.05 
 
 
671 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  33.71 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.79 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 
335 aa  84  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 
308 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25.89 
 
 
465 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  32.6 
 
 
424 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  33.17 
 
 
323 aa  81.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  27.33 
 
 
489 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  35.63 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.04 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  32.12 
 
 
495 aa  80.5  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.57 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.44 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
328 aa  80.1  0.00000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 
652 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
456 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  29.45 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  33.54 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.34 
 
 
345 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  31.43 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
323 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  33 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0979  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.441427  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  32.62 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  32.53 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
415 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  33.93 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.63 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.55 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  29.57 
 
 
239 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  31.76 
 
 
372 aa  77  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.09 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
365 aa  76.6  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  30.3 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  29.95 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  33.15 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  30.99 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  34.71 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  30.2 
 
 
553 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>