298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82348 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_82348  DNA-dependent ATPase of the nucleotide excision repair factor 4 complex  100 
 
 		 1343 aa  2796    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.968646  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01961  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10830)  31.51 
 
 		 1502 aa  273  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.288064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01930  DNA supercoiling, putative  24.88 
 
 		 585 aa  155  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42940  predicted protein  20.81 
 
 		 1337 aa  89.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.544378  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  22.48 
 
 		 1432 aa  87.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  29.05 
 
 		 1531 aa  78.6  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45116  predicted protein  30.72 
 
 		 1843 aa  77  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.116099  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15012  predicted protein  27.75 
 
 		 898 aa  75.9  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0934253  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  29.24 
 
 		 1198 aa  75.5  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  31.01 
 
 		 1386 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  33.58 
 
 		 1184 aa  72.8  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  35 
 
 		 1081 aa  73.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  38.21 
 
 		 1381 aa  72.4  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  32.31 
 
 		 900 aa  72.4  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 		 1449 aa  72  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 1102 aa  72  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  26.82 
 
 		 1132 aa  71.6  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  30.38 
 
 		 1362 aa  71.6  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31894  predicted protein  23.58 
 
 		 1594 aa  70.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  32.14 
 
 		 1112 aa  70.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  29.8 
 
 		 621 aa  69.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.53 
 
 		 1403 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  21.78 
 
 		 972 aa  68.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  30.06 
 
 		 959 aa  68.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  29.05 
 
 		 1250 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  30.2 
 
 		 1072 aa  67.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  30 
 
 		 977 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  29.23 
 
 		 1170 aa  66.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 		 1090 aa  65.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1277 aa  65.5  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.88 
 
 		 1261 aa  65.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 1129 aa  65.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  32.87 
 
 		 1185 aa  65.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  31.34 
 
 		 1096 aa  65.5  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1761 aa  64.3  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 		 1160 aa  64.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.94 
 
 		 1143 aa  64.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  28.77 
 
 		 1078 aa  64.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  26.98 
 
 		 1154 aa  64.3  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  34.71 
 
 		 901 aa  63.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01255  chromodomain helicase (Chd1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10290)  29.87 
 
 		 1517 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.959895  normal  0.880874 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  30.52 
 
 		 663 aa  63.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  33.09 
 
 		 1141 aa  63.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  32.14 
 
 		 1394 aa  63.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  29.05 
 
 		 1048 aa  63.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  30.5 
 
 		 1159 aa  64.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 1089 aa  63.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  38.16 
 
 		 922 aa  63.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  26.47 
 
 		 701 aa  63.2  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.06 
 
 		 895 aa  63.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  29.66 
 
 		 1045 aa  63.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.09 
 
 		 988 aa  63.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  32.03 
 
 		 1142 aa  63.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  28.78 
 
 		 1062 aa  62.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.75 
 
 		 1110 aa  62.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  27.19 
 
 		 924 aa  62.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  27.65 
 
 		 1163 aa  62.4  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  31.94 
 
 		 1088 aa  62.4  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01956  chromatin remodeling complex subunit (Chd3), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13440)  26.58 
 
 		 1443 aa  62.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.801646 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  25.83 
 
 		 1202 aa  62.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  24.43 
 
 		 1025 aa  62.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 		 1164 aa  62  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  36.13 
 
 		 1077 aa  62  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.67 
 
 		 1112 aa  62  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  25.66 
 
 		 1053 aa  62  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.75 
 
 		 925 aa  60.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.26 
 
 		 1026 aa  61.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  26.52 
 
 		 980 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  27.6 
 
 		 1019 aa  61.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  29.59 
 
 		 1150 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  29.86 
 
 		 1269 aa  61.6  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  28.07 
 
 		 991 aa  61.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 		 933 aa  60.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  25.17 
 
 		 849 aa  60.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 		 966 aa  60.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  32.62 
 
 		 1070 aa  60.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 		 1118 aa  60.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  33.06 
 
 		 917 aa  60.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  29.8 
 
 		 1437 aa  60.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 		 1048 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  30.89 
 
 		 617 aa  60.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  41.43 
 
 		 985 aa  60.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  32.62 
 
 		 1082 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  38.46 
 
 		 1164 aa  60.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  34.41 
 
 		 715 aa  60.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 982 aa  60.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  35.71 
 
 		 1086 aa  59.7  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 1155 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 1765 aa  60.1  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  32.82 
 
 		 918 aa  60.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  30.83 
 
 		 949 aa  59.7  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  35.71 
 
 		 806 aa  60.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  32.62 
 
 		 1082 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  32.62 
 
 		 1082 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  26.97 
 
 		 1127 aa  59.7  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  27.05 
 
 		 1359 aa  59.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  29.07 
 
 		 773 aa  59.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  30.99 
 
 		 1134 aa  59.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 1073 aa  59.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.91 
 
 		 1031 aa  59.3  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>