80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42940 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42940  predicted protein  100 
 
 		 1337 aa  2793    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.544378  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31894  predicted protein  26.28 
 
 		 1594 aa  162  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82348  DNA-dependent ATPase of the nucleotide excision repair factor 4 complex  21 
 
 		 1343 aa  73.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.968646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  24.91 
 
 		 1359 aa  72.4  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01961  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10830)  24.23 
 
 		 1502 aa  70.1  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.288064  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  21.31 
 
 		 972 aa  65.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  20.98 
 
 		 1170 aa  63.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  30 
 
 		 1086 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  30 
 
 		 806 aa  61.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  26.67 
 
 		 1132 aa  59.7  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  21.51 
 
 		 1127 aa  55.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  27.98 
 
 		 1184 aa  55.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  30.58 
 
 		 674 aa  54.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  32.76 
 
 		 1415 aa  54.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1277 aa  53.9  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  27.85 
 
 		 648 aa  53.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  28.77 
 
 		 1064 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 898 aa  52.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  27.34 
 
 		 1064 aa  52  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  25.94 
 
 		 1081 aa  52  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  28.72 
 
 		 842 aa  52  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  27.32 
 
 		 900 aa  52  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  27.56 
 
 		 1064 aa  51.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  27.56 
 
 		 1064 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  26.71 
 
 		 1064 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  26.21 
 
 		 1068 aa  51.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.85 
 
 		 559 aa  51.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  27.56 
 
 		 1064 aa  51.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  27.56 
 
 		 1064 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  27.56 
 
 		 1064 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  27.56 
 
 		 1064 aa  51.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.15 
 
 		 1171 aa  50.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  30.51 
 
 		 1112 aa  50.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 		 1066 aa  50.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  26.24 
 
 		 1127 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  29.37 
 
 		 892 aa  49.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  24.34 
 
 		 1246 aa  49.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  30.15 
 
 		 956 aa  49.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.9 
 
 		 1047 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  25.9 
 
 		 1047 aa  48.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  30.95 
 
 		 899 aa  48.5  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  26.11 
 
 		 1142 aa  48.5  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  28.39 
 
 		 988 aa  48.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  25.1 
 
 		 1566 aa  48.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36839  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1761 aa  47.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.13486  normal  0.0799284 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15642  predicted protein  25.21 
 
 		 1432 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.948384  normal  0.026294 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 1118 aa  48.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.57 
 
 		 977 aa  48.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.08 
 
 		 1031 aa  47.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 1029 aa  47.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  25.18 
 
 		 924 aa  47.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  26.32 
 
 		 1070 aa  47.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.05 
 
 		 1034 aa  47.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  32.86 
 
 		 886 aa  47.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  28.97 
 
 		 1198 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  26.04 
 
 		 1558 aa  47.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  29.25 
 
 		 991 aa  47.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  24.85 
 
 		 1161 aa  47.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.91 
 
 		 972 aa  46.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  19.81 
 
 		 715 aa  47  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 		 931 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 1002 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  26.06 
 
 		 1006 aa  46.6  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.18 
 
 		 925 aa  46.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 1048 aa  46.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 1050 aa  46.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  21.68 
 
 		 701 aa  46.2  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  24.54 
 
 		 1164 aa  45.8  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  31.25 
 
 		 1025 aa  45.8  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 1028 aa  45.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  28 
 
 		 1069 aa  45.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  23.59 
 
 		 985 aa  45.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  26.9 
 
 		 918 aa  45.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  35.21 
 
 		 1026 aa  45.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  28 
 
 		 1069 aa  45.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  27.67 
 
 		 1086 aa  45.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.92 
 
 		 917 aa  45.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  25.85 
 
 		 1088 aa  45.1  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  24.43 
 
 		 1068 aa  45.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  23.08 
 
 		 1407 aa  45.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>