197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47724 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  100 
 
 
646 aa  1346    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  37.5 
 
 
418 aa  241  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  28.72 
 
 
1106 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  32.18 
 
 
686 aa  101  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 
949 aa  86.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  25.31 
 
 
825 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 
1424 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.57 
 
 
2145 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.74 
 
 
1186 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  26.59 
 
 
1550 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  31.65 
 
 
1131 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
1088 aa  79  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1040 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 
1288 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
568 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.03 
 
 
568 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.67 
 
 
740 aa  75.5  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 
1105 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.44 
 
 
1212 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  31.36 
 
 
702 aa  72.4  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.36 
 
 
732 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
284 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
1290 aa  71.2  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 
924 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
966 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.16 
 
 
1404 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.2 
 
 
828 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1359  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 
333 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.07 
 
 
1328 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  25.51 
 
 
793 aa  67  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
412 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
1215 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  28.11 
 
 
708 aa  65.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  24.21 
 
 
807 aa  65.1  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
751 aa  64.7  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
857 aa  64.3  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  26.05 
 
 
493 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
911 aa  62.8  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
854 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 
782 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25.84 
 
 
694 aa  62  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  24.55 
 
 
836 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
785 aa  61.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.07 
 
 
2327 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
1526 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4168  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
326 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  25.46 
 
 
1228 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
3145 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.87 
 
 
885 aa  60.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 
814 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  27 
 
 
757 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 
767 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.8 
 
 
787 aa  59.3  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 
1060 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  29.02 
 
 
680 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.97 
 
 
2413 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47294  predicted protein  32.98 
 
 
777 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  28.38 
 
 
1429 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
1082 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
953 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  28.51 
 
 
1087 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  47.27 
 
 
256 aa  58.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.2 
 
 
1039 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
1028 aa  57.4  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  27.73 
 
 
1238 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
927 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  24.89 
 
 
311 aa  56.6  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  25.36 
 
 
809 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 
991 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  23.77 
 
 
672 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
481 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.42 
 
 
822 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.51 
 
 
771 aa  55.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 
632 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
809 aa  55.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
837 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  45.28 
 
 
259 aa  55.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
1063 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  30.39 
 
 
1731 aa  55.1  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  25.11 
 
 
1068 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 
573 aa  54.7  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  22.42 
 
 
622 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
843 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  25.35 
 
 
919 aa  54.7  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.86 
 
 
1009 aa  54.3  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  23.89 
 
 
919 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1241  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 
1366 aa  53.9  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0870262  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.7 
 
 
577 aa  53.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.55 
 
 
1507 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
1101 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  38.36 
 
 
253 aa  53.5  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.6 
 
 
828 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6223  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.35 
 
 
994 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.96 
 
 
1036 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
1313 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43024  predicted protein  24.56 
 
 
576 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000321984  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.65 
 
 
1056 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>