28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003702 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  85.71 
 
 
256 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  69.5 
 
 
259 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  53.54 
 
 
256 aa  256  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  50.49 
 
 
253 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  44.49 
 
 
261 aa  205  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  44.66 
 
 
261 aa  203  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  44.66 
 
 
261 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  43.7 
 
 
261 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  43.7 
 
 
261 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  43.31 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  44.49 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  43.31 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  43.87 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  40.87 
 
 
261 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  43.02 
 
 
260 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  40.08 
 
 
267 aa  182  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  40.08 
 
 
266 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  38.28 
 
 
259 aa  163  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  45.28 
 
 
646 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  28.21 
 
 
1106 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  26.32 
 
 
439 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  31.46 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  31.18 
 
 
418 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  26.67 
 
 
277 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  32.29 
 
 
274 aa  42.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  27.37 
 
 
247 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  26.45 
 
 
290 aa  42  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>