25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0841 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  528  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  57.6 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  57.2 
 
 		 261 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  57.6 
 
 		 261 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  57.2 
 
 		 261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  54.8 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  55.2 
 
 		 261 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  54.8 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  54.4 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  55.6 
 
 		 261 aa  258  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  51.39 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  51.2 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  50.8 
 
 		 260 aa  249  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  48.4 
 
 		 261 aa  228  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  40.87 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  37.85 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  40.99 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  38.28 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  42.94 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  44.64 
 
 		 646 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  24.19 
 
 		 418 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  33.33 
 
 		 1106 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  31.62 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  32.65 
 
 		 247 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  30.67 
 
 		 290 aa  42  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>