36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3178 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  530  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  61.15 
 
 		 267 aa  327  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  56.32 
 
 		 266 aa  296  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  58.43 
 
 		 261 aa  296  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  58.04 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  58.04 
 
 		 261 aa  291  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  58 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  55.56 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  55.38 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  55 
 
 		 261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  55 
 
 		 261 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  54.62 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  54.9 
 
 		 261 aa  275  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  48.4 
 
 		 259 aa  228  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  44.66 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  40.87 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  41.25 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  39.84 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  42.08 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  25.68 
 
 		 418 aa  52.4  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  30.65 
 
 		 1106 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0468  GTP pyrophosphokinase  23.5 
 
 		 742 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.135158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  27.42 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  30.3 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  30.67 
 
 		 646 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  30.3 
 
 		 216 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  30.3 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  23.23 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  28.57 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  28.57 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  30.3 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  24.53 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  29.29 
 
 		 216 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>