28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3846 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  85.82 
 
 		 261 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  85.82 
 
 		 261 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  85.06 
 
 		 261 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  78.16 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  77.78 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  77.78 
 
 		 261 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  77.39 
 
 		 261 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  75.86 
 
 		 261 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  58.4 
 
 		 267 aa  308  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  59.53 
 
 		 266 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  58.46 
 
 		 260 aa  300  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  58 
 
 		 261 aa  287  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  57.6 
 
 		 259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  46.83 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  44.66 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  44.22 
 
 		 253 aa  191  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  43.84 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  28.11 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  27.01 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  31.25 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  32.14 
 
 		 646 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  28.46 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  32.98 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  29.67 
 
 		 249 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  23.85 
 
 		 439 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  29.21 
 
 		 223 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>