26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0786 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  99.23 
 
 
261 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  97.7 
 
 
261 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  85.06 
 
 
261 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  79.31 
 
 
261 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  79.31 
 
 
261 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  78.93 
 
 
261 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  78.93 
 
 
261 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  75.86 
 
 
261 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  58.4 
 
 
267 aa  311  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  57.98 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  57.59 
 
 
260 aa  295  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  58.04 
 
 
261 aa  294  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  57.2 
 
 
259 aa  275  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  46.43 
 
 
259 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  43.87 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  49.51 
 
 
256 aa  198  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  39.3 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  42.86 
 
 
256 aa  168  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  29.5 
 
 
418 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  30.43 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  30.93 
 
 
646 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  26.19 
 
 
439 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  31.25 
 
 
247 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  25.35 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  26.67 
 
 
271 aa  42  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>