27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0684 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_0684  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  531  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00404741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3749  hypothetical protein  98.08 
 
 
261 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.511212  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3558  hypothetical protein  97.7 
 
 
261 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00233545  normal  0.0372974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3626  hypothetical protein  97.32 
 
 
261 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0790  hypothetical protein  81.99 
 
 
261 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0786  hypothetical protein  78.93 
 
 
261 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3180  hypothetical protein  78.93 
 
 
261 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0594296  normal  0.121226 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0758  hypothetical protein  78.16 
 
 
261 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0270421  normal  0.286638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3846  hypothetical protein  77.78 
 
 
261 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3510  hypothetical protein  56.87 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178381  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0910  hypothetical protein  56.54 
 
 
266 aa  299  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0596498  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2972  hypothetical protein  59.14 
 
 
260 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225401  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3178  hypothetical protein  55 
 
 
261 aa  281  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0841  hypothetical protein  54.4 
 
 
259 aa  260  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0847  hypothetical protein  45.06 
 
 
259 aa  203  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000167513  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003702  hypothetical protein  43.31 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.354988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02113  hypothetical protein  43.57 
 
 
256 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2632  hypothetical protein  40.86 
 
 
253 aa  186  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.535591  normal  0.96162 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0854  hypothetical protein  44.83 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49781  predicted protein  26.49 
 
 
418 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  29.91 
 
 
1106 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  31.62 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47724  predicted protein  28.35 
 
 
646 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  30.61 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  26.28 
 
 
439 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  28.04 
 
 
271 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  35.42 
 
 
277 aa  42  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>