More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0358 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  100 
 
 		 249 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  67.4 
 
 		 261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  51.49 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  56.6 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  54.13 
 
 		 277 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  56.65 
 
 		 239 aa  238  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  51.57 
 
 		 271 aa  228  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  52.68 
 
 		 274 aa  220  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  54.87 
 
 		 223 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  49.75 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  48.58 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  49.75 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  50.55 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  47.03 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  47.03 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  47.03 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  47.03 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  47.03 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  47.03 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  47.03 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  47.03 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  47.57 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  47.03 
 
 		 216 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  46.49 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  40.89 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  41.83 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  42.21 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  43.01 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  41.53 
 
 		 217 aa  161  7e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  41.53 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  41.53 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  41.33 
 
 		 224 aa  158  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  41.76 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  40.54 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  45.39 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  40.98 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  40.98 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  39.34 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  39.34 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  39.34 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  39.56 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  41.53 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  40 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  36.36 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  36.55 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  37.06 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  37.7 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  37.7 
 
 		 212 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  37.36 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  37.16 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  37.29 
 
 		 191 aa  128  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  38.27 
 
 		 203 aa  115  6.9999999999999995e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  34.78 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  33.51 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37060  RelA/SpoT protein  35.48 
 
 		 749 aa  68.6  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00582579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2518  GTP pyrophosphokinase  29.41 
 
 		 745 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.326663  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1638  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  34.68 
 
 		 750 aa  65.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1193  RelA/SpoT family protein  30.29 
 
 		 735 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000349735  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  34.4 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1990  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase  37.8 
 
 		 707 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1985  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase  39.5 
 
 		 707 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2029  GTP pyrophosphokinase  33.61 
 
 		 738 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178935  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002504  GTP pyrophosphokinase (p)ppGpp synthetase I  33.61 
 
 		 739 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000545051  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1462  GTP pyrophosphokinase  31.06 
 
 		 714 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00122903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1033  GTP diphosphokinase  35.16 
 
 		 734 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0165822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2113  GTP diphosphokinase  34.68 
 
 		 770 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.978919  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03401  GTP pyrophosphokinase  35.77 
 
 		 727 aa  64.3  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00113456  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1533  RelA/SpoT family protein  30.3 
 
 		 714 aa  64.3  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000577209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4576  GTP pyrophosphokinase  32.26 
 
 		 747 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52180  GTP pyrophosphokinase  32.26 
 
 		 747 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00224344  normal  0.0200902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1257  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.26 
 
 		 746 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648227  normal  0.0100627 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03528  GTP pyrophosphokinase  33.61 
 
 		 739 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1656  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.26 
 
 		 746 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.764333  normal  0.672411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3276  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.93 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00140611  normal  0.0304818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.3 
 
 		 827 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  0.00000728185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  32.3 
 
 		 815 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2238  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.68 
 
 		 745 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4062  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.26 
 
 		 746 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.733474  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3178  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.93 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00141228  normal  0.185279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02629  (p)ppGpp synthetase I/GTP pyrophosphokinase  34.43 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000829976  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2928  GDP/GTP pyrophosphokinase  34.43 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000188713  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0904  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  34.43 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000660798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4115  GTP pyrophosphokinase  31.97 
 
 		 737 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0928  GDP/GTP pyrophosphokinase  34.43 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000382583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3115  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.93 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0106723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1217  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.45 
 
 		 746 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14010  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  31.02 
 
 		 809 aa  63.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.698973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3088  GDP/GTP pyrophosphokinase  34.43 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000221392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3162  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.93 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00447218  normal  0.0412564 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2922  GDP/GTP pyrophosphokinase  34.43 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000016084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4044  GDP/GTP pyrophosphokinase  34.43 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000409177  normal  0.332873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3097  GDP/GTP pyrophosphokinase  31.93 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000040075  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02591  hypothetical protein  34.43 
 
 		 744 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000104096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>