More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19730 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19730  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.353264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26220  hypothetical protein  55.71 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.266384  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1201  RelA/SpoT domain protein  55.2 
 
 		 239 aa  235  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4155  RelA/SpoT domain protein  52 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2670  RelA/SpoT domain protein  54.41 
 
 		 261 aa  228  8e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2232  RelA/SpoT domain protein  51.35 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.231688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0274  RelA/SpoT domain-containing protein  49.79 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2189  RelA/SpoT domain-containing protein  54.3 
 
 		 223 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0358  RelA/SpoT domain protein  52.68 
 
 		 249 aa  209  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0020  RelA/SpoT domain-containing protein  47.42 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000113301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14230  hypothetical protein  44.96 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00309565  decreased coverage  0.00445138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2268  RelA/SpoT domain protein  51.5 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22200  hypothetical protein  46.57 
 
 		 290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3068  RelA/SpoT domain-containing protein  47.89 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00277966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4242  hypothetical protein  47.57 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4080  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  47.57 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000763047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4091  GTP diphosphokinase (GTP pyrophosphokinase)  47.57 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.068396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4572  hypothetical protein  47.57 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4424  hypothetical protein  47.57 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4192  RelA/SpoT domain-containing protein  48.11 
 
 		 216 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4425  hypothetical protein  47.57 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4476  hypothetical protein  47.57 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0773  hypothetical protein  48.11 
 
 		 216 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.315657  normal  0.820863 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4464  hypothetical protein  47.57 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3227  RelA/SpoT domain protein  43.81 
 
 		 230 aa  188  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000011111  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0219  RelA/SpoT domain protein  44.67 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.380399  normal  0.748284 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2065  hypothetical protein  40.96 
 
 		 233 aa  170  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0383837  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1091  RelA/SpoT domain protein  42.08 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0275  hypothetical protein  41.51 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00334337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2357  RelA/SpoT domain protein  43.16 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2532  RelA/SpoT domain-containing protein  38.92 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00175026  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2584  RelA/SpoT domain-containing protein  38.92 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0720868  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0635  relA/spoT family protein  40.96 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000118611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0621  relA/spoT family protein  40.96 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000073544  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0572  RelA/SpoT domain-containing protein  38.71 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000868379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0944  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  39.02 
 
 		 224 aa  146  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00002331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0914  RelA/SpoT domain-containing protein  39.25 
 
 		 212 aa  146  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0775  RelA/SpoT domain protein  37.1 
 
 		 210 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1354  RelA_SpoT domain-containing protein  38.5 
 
 		 208 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  7.69337e-16  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1320  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1358  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1119  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00142232  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1101  GTP pyrophosphokinase  38.71 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1282  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1095  GTP pyrophosphokinase  38.71 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000691421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1253  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1212  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4088  hypothetical protein  38.71 
 
 		 212 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1023  RelA/SpoT domain-containing protein  37.63 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000177866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1004  RelA/SpoT domain-containing protein  37.63 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00135131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1108  RelA/SpoT domain-containing protein  38.71 
 
 		 212 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1630  RelA/SpoT domain protein  37.1 
 
 		 212 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1095  GTP pyrophosphokinase family protein  39.01 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0406163  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2793  RelA/SpoT domain-containing protein  37.3 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000763425  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1423  RelA_SpoT domain-containing protein  38.17 
 
 		 224 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.191606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0586  GTP pyrophosphokinase  39.25 
 
 		 211 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411045  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0408  RelA_SpoT domain-containing protein  37.91 
 
 		 226 aa  132  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000250379  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0678  RelA_SpoT domain-containing protein  36.31 
 
 		 191 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.272794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1329  GTP pyrophosphokinase family protein  37.58 
 
 		 208 aa  112  6e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000157341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0709  ppGpp synthetase/hydrolase catalytic subunit  36.26 
 
 		 203 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000232311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23940  hypothetical protein  35.64 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00231271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4146  RelA/SpoT domain-containing protein  28.57 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0405555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3586  RelA/SpoT domain protein  27.78 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000408505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0070  RelA/SpoT domain protein  28.12 
 
 		 570 aa  55.8  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2392  RelA/SpoT family protein  30.95 
 
 		 743 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997464  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0199  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase ((ppGpp)ase)  39.51 
 
 		 667 aa  53.1  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1885  RelA/SpoT domain protein  27.97 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2062  RelA/SpoT domain-containing protein  27.97 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.123268  normal  0.165983 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2090  RelA/SpoT protein  33.88 
 
 		 814 aa  52.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2587  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.86 
 
 		 788 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1711  RelA/SpoT domain-containing protein  27.75 
 
 		 388 aa  52  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000626045  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1815  RelA/SpoT family protein  30.66 
 
 		 815 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.093472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3258  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.43 
 
 		 720 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1428  RelA/SpoT  30.3 
 
 		 362 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.228493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1805  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  30.66 
 
 		 827 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.388708  decreased coverage  0.00000728185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2888  RelA/SpoT domain protein  27.06 
 
 		 362 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.5584100000000003e-34 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02364  guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase ((ppGpp)ase)  31.16 
 
 		 712 aa  52  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2489  RelA/SpoT domain-containing protein  27.78 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.79403  normal  0.101918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4386  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.71 
 
 		 705 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0303  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.97 
 
 		 705 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1670  RelA/SpoT family protein  31.97 
 
 		 705 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443961  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2576  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.89 
 
 		 705 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0223055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  32.61 
 
 		 820 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.865833  normal  0.439631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4366  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  37.97 
 
 		 736 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.172141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1420  RelA/SpoT domain protein  31.62 
 
 		 381 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.39446e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1399  RelA/SpoT domain protein  27.86 
 
 		 365 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000071471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3527  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  28.85 
 
 		 701 aa  49.7  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.982777  normal  0.148068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1680  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  27.27 
 
 		 717 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0127021 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1298  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  28.57 
 
 		 740 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000189131  hitchhiker  0.0061753 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0587  guanosine polyphosphate pyrophosphohydrolase/synthetase  31.19 
 
 		 748 aa  49.7  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00257021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2442  RelA/SpoT domain-containing protein  31.9 
 
 		 340 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0731  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  35.11 
 
 		 769 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.583794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1455  RelA/SpoT domain-containing protein  23.12 
 
 		 359 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000111353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1800  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  29.2 
 
 		 723 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12840  (p)ppGpp synthetase, RelA/SpoT family  31.34 
 
 		 759 aa  49.3  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00420725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4220  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 		 760 aa  49.3  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1338  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  33.94 
 
 		 742 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5146  RelA/SpoT domain-containing protein  29.45 
 
 		 574 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2071  (p)ppGpp synthetase I (GTP pyrophosphokinase), SpoT/RelA  36.71 
 
 		 751 aa  48.9  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000208286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2677  (p)ppGpp synthetase I, SpoT/RelA  31.65 
 
 		 700 aa  48.9  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.525072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>