More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0138 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0138  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 327 aa  672    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.465735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0596  ATP dependent DNA ligase  37.11 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1123  DNA ligase, putative  35.15 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.91674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0365  ATP dependent DNA ligase  34.76 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0278595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1649  ATP dependent DNA ligase  29.54 
 
 		 314 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.87 
 
 		 495 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.85 
 
 		 797 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  29.08 
 
 		 313 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0201  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  28.48 
 
 		 778 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.173659  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  28.34 
 
 		 759 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  28.84 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  30.32 
 
 		 477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  28.39 
 
 		 822 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  32.71 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  28.16 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  26.96 
 
 		 657 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  28.94 
 
 		 758 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  28.94 
 
 		 758 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  28.99 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  27.24 
 
 		 436 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  28.34 
 
 		 766 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  28.3 
 
 		 758 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  26.85 
 
 		 847 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  27.92 
 
 		 763 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  28.93 
 
 		 813 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  26.49 
 
 		 815 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  27.67 
 
 		 316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  27.88 
 
 		 608 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  26.74 
 
 		 896 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  27.83 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6404  DNA ligase D  31.56 
 
 		 646 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0822092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  27.36 
 
 		 818 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  26.27 
 
 		 358 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  29.21 
 
 		 855 aa  109  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  26.82 
 
 		 307 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  25.74 
 
 		 376 aa  106  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  27.39 
 
 		 902 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  26.51 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  25.57 
 
 		 831 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  24.85 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  24.68 
 
 		 656 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  26.92 
 
 		 882 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  28.01 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  25.31 
 
 		 865 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  27.33 
 
 		 861 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  23.73 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  25.08 
 
 		 901 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  26.5 
 
 		 816 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  24.21 
 
 		 658 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  24.77 
 
 		 684 aa  99.4  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  26.27 
 
 		 852 aa  99.4  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  24.85 
 
 		 888 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  24.61 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  23.85 
 
 		 882 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  24.61 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  26.84 
 
 		 845 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  25.69 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  26.92 
 
 		 828 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  25.08 
 
 		 683 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3103  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  22.9 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  24.13 
 
 		 350 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  26.27 
 
 		 651 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  25.8 
 
 		 881 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  24.77 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  25.63 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  26.52 
 
 		 845 aa  93.6  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  24.2 
 
 		 644 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  26.03 
 
 		 883 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  26.18 
 
 		 834 aa  92.8  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1702  DNA ligase D  24.5 
 
 		 877 aa  92.4  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170827  hitchhiker  0.00786599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  23.86 
 
 		 858 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0353  ATP-dependent DNA ligase  23.64 
 
 		 913 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.344654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  25.8 
 
 		 853 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3330  DNA ligase D  24.92 
 
 		 896 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.580871  normal  0.138663 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  24.13 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5331  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  26.1 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  26.32 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  22.87 
 
 		 864 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  26.6 
 
 		 825 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  26.1 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  23.94 
 
 		 893 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  26.9 
 
 		 374 aa  89.7  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  23.89 
 
 		 895 aa  89  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  24.44 
 
 		 843 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  26.81 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  26.81 
 
 		 353 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  24.04 
 
 		 939 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  24.36 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  23.53 
 
 		 863 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  23.34 
 
 		 856 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  23.27 
 
 		 867 aa  86.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  24 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  22.86 
 
 		 866 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3852  ATP dependent DNA ligase  26.18 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  24.84 
 
 		 866 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  26.95 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  25.8 
 
 		 651 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  25.97 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3452  ATP dependent DNA ligase  24.34 
 
 		 534 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  24.93 
 
 		 833 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>