More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5554 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5554  ATP dependent DNA ligase  100 
 
 		 314 aa  618  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.71197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  45.05 
 
 		 374 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4139  ATP-dependent DNA ligase  46.87 
 
 		 345 aa  265  8e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  45.93 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  45.64 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4122  ATP-dependent DNA ligase  47.69 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.582664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  46.59 
 
 		 346 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  44.09 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  45.69 
 
 		 363 aa  255  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3859  ATP-dependent DNA ligase  46.63 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0092  ATP-dependent DNA ligase  45.68 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  45.35 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  45.32 
 
 		 358 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5212  ATP-dependent DNA ligase  44.55 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.240793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3719  ATP-dependent DNA ligase  46.15 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0581582 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  45.97 
 
 		 360 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  45.77 
 
 		 360 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  44.38 
 
 		 365 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  46.36 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2700  ATP-dependent DNA ligase  44.41 
 
 		 365 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  45.24 
 
 		 371 aa  245  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  44.87 
 
 		 353 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  44.57 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  44.57 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  43.64 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1252  ATP dependent DNA ligase  47.18 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.804327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  43.32 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  43.32 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  44.07 
 
 		 353 aa  235  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  42.9 
 
 		 369 aa  235  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3905  ATP-dependent DNA ligase  42.24 
 
 		 341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.603635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5820  ATP-dependent DNA ligase  44.15 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  43.11 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  40.48 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  45.45 
 
 		 352 aa  225  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  42.23 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  44.77 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0864  ATP-dependent DNA ligase  45.17 
 
 		 341 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  42.86 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1674  ATP dependent DNA ligase  42.56 
 
 		 390 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  41.36 
 
 		 366 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0816  ATP-dependent DNA ligase  44.58 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0868  ATP-dependent DNA ligase  44.86 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1585  ATP-dependent DNA ligase  44.12 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.143721  normal  0.0720309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  39.53 
 
 		 408 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15600  ATP-dependent DNA ligase  44.12 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.138561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  44.41 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5284  ATP-dependent DNA ligase  42.76 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  37.62 
 
 		 321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36.33 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4500  ATP dependent DNA ligase  35.63 
 
 		 344 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.15 
 
 		 495 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  34.04 
 
 		 847 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  32.09 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  32.49 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  36.89 
 
 		 845 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2271  ATP dependent DNA ligase  34.98 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  34.06 
 
 		 845 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  30.34 
 
 		 651 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  33.1 
 
 		 822 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  32.54 
 
 		 816 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  31.37 
 
 		 813 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  40.42 
 
 		 477 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4352  DNA polymerase LigD ligase region  33.12 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  33.85 
 
 		 901 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  32.18 
 
 		 918 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0520  ATP-dependent DNA ligase  33.87 
 
 		 828 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  30.57 
 
 		 832 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  33.02 
 
 		 656 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.43 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6329  ATP-dependent DNA ligase  31.45 
 
 		 895 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  32.25 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  29.56 
 
 		 657 aa  102  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0119  ATP dependent DNA ligase  35.28 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.262895  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  30.28 
 
 		 881 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.96 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  28.62 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  30.53 
 
 		 848 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1736  ATP-dependent DNA ligase  30.28 
 
 		 888 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.946456 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3907  ATP-dependent DNA ligase  30.77 
 
 		 900 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.989644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  29.84 
 
 		 608 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  31.46 
 
 		 867 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  31.65 
 
 		 831 aa  99.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  33.47 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  30.67 
 
 		 863 aa  99.8  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4160  ATP-dependent DNA ligase  34.04 
 
 		 513 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.145262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0365  DNA ligase D  28.15 
 
 		 902 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  32.28 
 
 		 815 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  32.93 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  32.93 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4290  ATP-dependent DNA ligase  33.43 
 
 		 513 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  30.09 
 
 		 883 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  34.01 
 
 		 797 aa  97.4  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  29.38 
 
 		 861 aa  96.7  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0568  DNA ligase D  27.85 
 
 		 818 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000109107  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  30.94 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  30.99 
 
 		 343 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  31.6 
 
 		 847 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  30.43 
 
 		 911 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>